Protein–RNA interactions for Protein: Q3THW5

H2afv, Histone H2A.V, mousemouse

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2afvQ3THW5 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
H2afvQ3THW5 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
H2afvQ3THW5 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
H2afvQ3THW5 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
H2afvQ3THW5 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
H2afvQ3THW5 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
H2afvQ3THW5 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
H2afvQ3THW5 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
H2afvQ3THW5 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
H2afvQ3THW5 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
H2afvQ3THW5 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
H2afvQ3THW5 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
H2afvQ3THW5 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
H2afvQ3THW5 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
H2afvQ3THW5 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
H2afvQ3THW5 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
H2afvQ3THW5 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
H2afvQ3THW5 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
H2afvQ3THW5 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
H2afvQ3THW5 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
H2afvQ3THW5 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
H2afvQ3THW5 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
H2afvQ3THW5 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
H2afvQ3THW5 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
H2afvQ3THW5 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
H2afvQ3THW5 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
H2afvQ3THW5 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
H2afvQ3THW5 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
H2afvQ3THW5 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
H2afvQ3THW5 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
H2afvQ3THW5 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
H2afvQ3THW5 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
H2afvQ3THW5 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
H2afvQ3THW5 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
H2afvQ3THW5 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
H2afvQ3THW5 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
H2afvQ3THW5 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
H2afvQ3THW5 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
H2afvQ3THW5 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
H2afvQ3THW5 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
H2afvQ3THW5 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
H2afvQ3THW5 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
H2afvQ3THW5 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
H2afvQ3THW5 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
H2afvQ3THW5 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
H2afvQ3THW5 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
H2afvQ3THW5 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
H2afvQ3THW5 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
H2afvQ3THW5 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
H2afvQ3THW5 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
H2afvQ3THW5 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
H2afvQ3THW5 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
H2afvQ3THW5 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
H2afvQ3THW5 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
H2afvQ3THW5 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
H2afvQ3THW5 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
H2afvQ3THW5 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
H2afvQ3THW5 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
H2afvQ3THW5 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
H2afvQ3THW5 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
H2afvQ3THW5 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
H2afvQ3THW5 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
H2afvQ3THW5 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
H2afvQ3THW5 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
H2afvQ3THW5 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
H2afvQ3THW5 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
H2afvQ3THW5 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
H2afvQ3THW5 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
H2afvQ3THW5 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
H2afvQ3THW5 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
H2afvQ3THW5 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
H2afvQ3THW5 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
H2afvQ3THW5 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
H2afvQ3THW5 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
H2afvQ3THW5 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
H2afvQ3THW5 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
H2afvQ3THW5 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
H2afvQ3THW5 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
H2afvQ3THW5 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
H2afvQ3THW5 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
H2afvQ3THW5 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
H2afvQ3THW5 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
H2afvQ3THW5 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
H2afvQ3THW5 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
H2afvQ3THW5 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
H2afvQ3THW5 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
H2afvQ3THW5 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
H2afvQ3THW5 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
H2afvQ3THW5 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
H2afvQ3THW5 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
H2afvQ3THW5 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
H2afvQ3THW5 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
H2afvQ3THW5 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
H2afvQ3THW5 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
H2afvQ3THW5 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
H2afvQ3THW5 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
H2afvQ3THW5 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
H2afvQ3THW5 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
H2afvQ3THW5 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
H2afvQ3THW5 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.5 ms