Protein–RNA interactions for Protein: Q3TA59

Jmjd8, JmjC domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Jmjd8Q3TA59 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Jmjd8Q3TA59 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Jmjd8Q3TA59 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Jmjd8Q3TA59 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Jmjd8Q3TA59 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Jmjd8Q3TA59 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Jmjd8Q3TA59 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Jmjd8Q3TA59 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Jmjd8Q3TA59 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Jmjd8Q3TA59 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Jmjd8Q3TA59 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Jmjd8Q3TA59 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Jmjd8Q3TA59 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Jmjd8Q3TA59 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Jmjd8Q3TA59 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Jmjd8Q3TA59 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Jmjd8Q3TA59 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Jmjd8Q3TA59 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Jmjd8Q3TA59 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Jmjd8Q3TA59 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Jmjd8Q3TA59 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Jmjd8Q3TA59 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Jmjd8Q3TA59 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Jmjd8Q3TA59 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Jmjd8Q3TA59 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Jmjd8Q3TA59 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Jmjd8Q3TA59 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Jmjd8Q3TA59 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Jmjd8Q3TA59 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Jmjd8Q3TA59 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Jmjd8Q3TA59 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Jmjd8Q3TA59 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Jmjd8Q3TA59 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Jmjd8Q3TA59 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Jmjd8Q3TA59 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Jmjd8Q3TA59 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Jmjd8Q3TA59 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Jmjd8Q3TA59 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Jmjd8Q3TA59 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Jmjd8Q3TA59 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Jmjd8Q3TA59 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Jmjd8Q3TA59 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Jmjd8Q3TA59 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Jmjd8Q3TA59 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Jmjd8Q3TA59 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Jmjd8Q3TA59 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Jmjd8Q3TA59 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Jmjd8Q3TA59 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Jmjd8Q3TA59 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Jmjd8Q3TA59 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Jmjd8Q3TA59 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Jmjd8Q3TA59 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Jmjd8Q3TA59 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Jmjd8Q3TA59 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Jmjd8Q3TA59 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Jmjd8Q3TA59 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Jmjd8Q3TA59 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Jmjd8Q3TA59 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Jmjd8Q3TA59 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Jmjd8Q3TA59 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Jmjd8Q3TA59 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Jmjd8Q3TA59 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Jmjd8Q3TA59 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Jmjd8Q3TA59 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Jmjd8Q3TA59 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Jmjd8Q3TA59 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Jmjd8Q3TA59 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Jmjd8Q3TA59 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Jmjd8Q3TA59 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Jmjd8Q3TA59 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Jmjd8Q3TA59 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Jmjd8Q3TA59 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Jmjd8Q3TA59 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Jmjd8Q3TA59 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Jmjd8Q3TA59 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Jmjd8Q3TA59 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Jmjd8Q3TA59 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Jmjd8Q3TA59 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Jmjd8Q3TA59 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Jmjd8Q3TA59 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Jmjd8Q3TA59 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Jmjd8Q3TA59 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Jmjd8Q3TA59 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Jmjd8Q3TA59 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Jmjd8Q3TA59 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Jmjd8Q3TA59 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Jmjd8Q3TA59 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Jmjd8Q3TA59 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Jmjd8Q3TA59 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Jmjd8Q3TA59 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Jmjd8Q3TA59 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Jmjd8Q3TA59 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Jmjd8Q3TA59 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Jmjd8Q3TA59 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Jmjd8Q3TA59 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Jmjd8Q3TA59 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Jmjd8Q3TA59 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Jmjd8Q3TA59 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Jmjd8Q3TA59 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Jmjd8Q3TA59 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms