Protein–RNA interactions for Protein: Q2TV84

Trpm1, Transient receptor potential cation channel subfamily M member 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpm1Q2TV84 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35,22■■■■□ 3,23
Trpm1Q2TV84 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,21■■■■□ 3,23
Trpm1Q2TV84 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,21■■■■□ 3,23
Trpm1Q2TV84 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC35,2■■■■□ 3,23
Trpm1Q2TV84 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35,18■■■■□ 3,22
Trpm1Q2TV84 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC35,18■■■■□ 3,22
Trpm1Q2TV84 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,17■■■■□ 3,22
Trpm1Q2TV84 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC35,17■■■■□ 3,22
Trpm1Q2TV84 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC35,17■■■■□ 3,22
Trpm1Q2TV84 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,16■■■■□ 3,22
Trpm1Q2TV84 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC35,15■■■■□ 3,22
Trpm1Q2TV84 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC35,14■■■■□ 3,22
Trpm1Q2TV84 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,14■■■■□ 3,22
Trpm1Q2TV84 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC35,14■■■■□ 3,22
Trpm1Q2TV84 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35,13■■■■□ 3,21
Trpm1Q2TV84 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,13■■■■□ 3,21
Trpm1Q2TV84 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,13■■■■□ 3,21
Trpm1Q2TV84 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC35,12■■■■□ 3,21
Trpm1Q2TV84 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35,1■■■■□ 3,21
Trpm1Q2TV84 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35,1■■■■□ 3,21
Trpm1Q2TV84 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,09■■■■□ 3,21
Trpm1Q2TV84 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC35,09■■■■□ 3,21
Trpm1Q2TV84 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,08■■■■□ 3,21
Trpm1Q2TV84 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC35,08■■■■□ 3,21
Trpm1Q2TV84 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC35,06■■■■□ 3,2
Trpm1Q2TV84 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC35,06■■■■□ 3,2
Trpm1Q2TV84 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35,05■■■■□ 3,2
Trpm1Q2TV84 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,04■■■■□ 3,2
Trpm1Q2TV84 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC35,04■■■■□ 3,2
Trpm1Q2TV84 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,03■■■■□ 3,2
Trpm1Q2TV84 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,03■■■■□ 3,2
Trpm1Q2TV84 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC35,02■■■■□ 3,2
Trpm1Q2TV84 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,02■■■■□ 3,2
Trpm1Q2TV84 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3,19
Trpm1Q2TV84 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC35■■■■□ 3,19
Trpm1Q2TV84 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC35■■■■□ 3,19
Trpm1Q2TV84 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34,99■■■■□ 3,19
Trpm1Q2TV84 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC34,99■■■■□ 3,19
Trpm1Q2TV84 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC34,98■■■■□ 3,19
Trpm1Q2TV84 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC34,98■■■■□ 3,19
Trpm1Q2TV84 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,97■■■■□ 3,19
Trpm1Q2TV84 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC34,97■■■■□ 3,19
Trpm1Q2TV84 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,97■■■■□ 3,19
Trpm1Q2TV84 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,96■■■■□ 3,19
Trpm1Q2TV84 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,96■■■■□ 3,19
Trpm1Q2TV84 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC34,96■■■■□ 3,19
Trpm1Q2TV84 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,95■■■■□ 3,19
Trpm1Q2TV84 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,95■■■■□ 3,19
Trpm1Q2TV84 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,95■■■■□ 3,19
Trpm1Q2TV84 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,94■■■■□ 3,18
Trpm1Q2TV84 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,93■■■■□ 3,18
Trpm1Q2TV84 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,93■■■■□ 3,18
Trpm1Q2TV84 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,93■■■■□ 3,18
Trpm1Q2TV84 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,93■■■■□ 3,18
Trpm1Q2TV84 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,92■■■■□ 3,18
Trpm1Q2TV84 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC34,91■■■■□ 3,18
Trpm1Q2TV84 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,89■■■■□ 3,18
Trpm1Q2TV84 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,89■■■■□ 3,18
Trpm1Q2TV84 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,89■■■■□ 3,18
Trpm1Q2TV84 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,88■■■■□ 3,17
Trpm1Q2TV84 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34,88■■■■□ 3,17
Trpm1Q2TV84 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC34,86■■■■□ 3,17
Trpm1Q2TV84 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC34,86■■■■□ 3,17
Trpm1Q2TV84 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34,85■■■■□ 3,17
Trpm1Q2TV84 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC34,85■■■■□ 3,17
Trpm1Q2TV84 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC34,84■■■■□ 3,17
Trpm1Q2TV84 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC34,84■■■■□ 3,17
Trpm1Q2TV84 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC34,84■■■■□ 3,17
Trpm1Q2TV84 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,84■■■■□ 3,17
Trpm1Q2TV84 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,84■■■■□ 3,17
Trpm1Q2TV84 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC34,83■■■■□ 3,17
Trpm1Q2TV84 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC34,83■■■■□ 3,17
Trpm1Q2TV84 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC34,83■■■■□ 3,17
Trpm1Q2TV84 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,82■■■■□ 3,16
Trpm1Q2TV84 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC34,81■■■■□ 3,16
Trpm1Q2TV84 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC34,81■■■■□ 3,16
Trpm1Q2TV84 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC34,81■■■■□ 3,16
Trpm1Q2TV84 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC34,81■■■■□ 3,16
Trpm1Q2TV84 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,81■■■■□ 3,16
Trpm1Q2TV84 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34,81■■■■□ 3,16
Trpm1Q2TV84 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC34,8■■■■□ 3,16
Trpm1Q2TV84 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,79■■■■□ 3,16
Trpm1Q2TV84 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,79■■■■□ 3,16
Trpm1Q2TV84 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,79■■■■□ 3,16
Trpm1Q2TV84 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC34,79■■■■□ 3,16
Trpm1Q2TV84 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34,78■■■■□ 3,16
Trpm1Q2TV84 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC34,77■■■■□ 3,16
Trpm1Q2TV84 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34,77■■■■□ 3,16
Trpm1Q2TV84 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,77■■■■□ 3,16
Trpm1Q2TV84 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,75■■■■□ 3,15
Trpm1Q2TV84 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC34,74■■■■□ 3,15
Trpm1Q2TV84 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,74■■■■□ 3,15
Trpm1Q2TV84 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC34,74■■■■□ 3,15
Trpm1Q2TV84 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC34,73■■■■□ 3,15
Trpm1Q2TV84 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34,73■■■■□ 3,15
Trpm1Q2TV84 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,72■■■■□ 3,15
Trpm1Q2TV84 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,72■■■■□ 3,15
Trpm1Q2TV84 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34,72■■■■□ 3,15
Trpm1Q2TV84 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC34,71■■■■□ 3,15
Trpm1Q2TV84 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34,7■■■■□ 3,15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,7 ms