Protein–RNA interactions for Protein: Q2TJ95

Rspo3, R-spondin-3, mousemouse

Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rspo3Q2TJ95 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rspo3Q2TJ95 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rspo3Q2TJ95 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rspo3Q2TJ95 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rspo3Q2TJ95 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rspo3Q2TJ95 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rspo3Q2TJ95 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rspo3Q2TJ95 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rspo3Q2TJ95 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rspo3Q2TJ95 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Rspo3Q2TJ95 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rspo3Q2TJ95 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rspo3Q2TJ95 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rspo3Q2TJ95 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rspo3Q2TJ95 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rspo3Q2TJ95 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rspo3Q2TJ95 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rspo3Q2TJ95 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rspo3Q2TJ95 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rspo3Q2TJ95 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rspo3Q2TJ95 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rspo3Q2TJ95 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rspo3Q2TJ95 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rspo3Q2TJ95 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rspo3Q2TJ95 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Rspo3Q2TJ95 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Rspo3Q2TJ95 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rspo3Q2TJ95 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rspo3Q2TJ95 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rspo3Q2TJ95 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rspo3Q2TJ95 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rspo3Q2TJ95 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rspo3Q2TJ95 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rspo3Q2TJ95 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rspo3Q2TJ95 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rspo3Q2TJ95 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rspo3Q2TJ95 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rspo3Q2TJ95 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rspo3Q2TJ95 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rspo3Q2TJ95 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rspo3Q2TJ95 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rspo3Q2TJ95 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rspo3Q2TJ95 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rspo3Q2TJ95 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rspo3Q2TJ95 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rspo3Q2TJ95 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rspo3Q2TJ95 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rspo3Q2TJ95 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rspo3Q2TJ95 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rspo3Q2TJ95 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rspo3Q2TJ95 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rspo3Q2TJ95 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rspo3Q2TJ95 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Rspo3Q2TJ95 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rspo3Q2TJ95 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rspo3Q2TJ95 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rspo3Q2TJ95 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rspo3Q2TJ95 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rspo3Q2TJ95 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rspo3Q2TJ95 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rspo3Q2TJ95 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rspo3Q2TJ95 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rspo3Q2TJ95 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rspo3Q2TJ95 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rspo3Q2TJ95 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rspo3Q2TJ95 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rspo3Q2TJ95 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rspo3Q2TJ95 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rspo3Q2TJ95 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rspo3Q2TJ95 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rspo3Q2TJ95 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rspo3Q2TJ95 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Rspo3Q2TJ95 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Rspo3Q2TJ95 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rspo3Q2TJ95 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rspo3Q2TJ95 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Rspo3Q2TJ95 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rspo3Q2TJ95 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rspo3Q2TJ95 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rspo3Q2TJ95 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rspo3Q2TJ95 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rspo3Q2TJ95 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rspo3Q2TJ95 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rspo3Q2TJ95 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rspo3Q2TJ95 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rspo3Q2TJ95 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rspo3Q2TJ95 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rspo3Q2TJ95 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rspo3Q2TJ95 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rspo3Q2TJ95 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rspo3Q2TJ95 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rspo3Q2TJ95 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rspo3Q2TJ95 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Rspo3Q2TJ95 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rspo3Q2TJ95 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rspo3Q2TJ95 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rspo3Q2TJ95 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rspo3Q2TJ95 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Rspo3Q2TJ95 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rspo3Q2TJ95 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms