Protein–RNA interactions for Protein: Q2NKI2

Vax1, Ventral anterior homeobox 1, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vax1Q2NKI2 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Vax1Q2NKI2 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Vax1Q2NKI2 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Vax1Q2NKI2 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Vax1Q2NKI2 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Vax1Q2NKI2 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Vax1Q2NKI2 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Vax1Q2NKI2 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Vax1Q2NKI2 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Vax1Q2NKI2 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Vax1Q2NKI2 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Vax1Q2NKI2 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Vax1Q2NKI2 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Vax1Q2NKI2 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Vax1Q2NKI2 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Vax1Q2NKI2 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Vax1Q2NKI2 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Vax1Q2NKI2 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Vax1Q2NKI2 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Vax1Q2NKI2 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Vax1Q2NKI2 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Vax1Q2NKI2 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Vax1Q2NKI2 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Vax1Q2NKI2 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Vax1Q2NKI2 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Vax1Q2NKI2 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Vax1Q2NKI2 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Vax1Q2NKI2 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Vax1Q2NKI2 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Vax1Q2NKI2 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Vax1Q2NKI2 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Vax1Q2NKI2 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Vax1Q2NKI2 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Vax1Q2NKI2 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Vax1Q2NKI2 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Vax1Q2NKI2 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Vax1Q2NKI2 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Vax1Q2NKI2 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Vax1Q2NKI2 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Vax1Q2NKI2 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Vax1Q2NKI2 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Vax1Q2NKI2 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Vax1Q2NKI2 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Vax1Q2NKI2 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Vax1Q2NKI2 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Vax1Q2NKI2 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Vax1Q2NKI2 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Vax1Q2NKI2 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Vax1Q2NKI2 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Vax1Q2NKI2 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Vax1Q2NKI2 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Vax1Q2NKI2 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Vax1Q2NKI2 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Vax1Q2NKI2 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Vax1Q2NKI2 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Vax1Q2NKI2 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Vax1Q2NKI2 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Vax1Q2NKI2 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Vax1Q2NKI2 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Vax1Q2NKI2 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Vax1Q2NKI2 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Vax1Q2NKI2 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Vax1Q2NKI2 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Vax1Q2NKI2 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Vax1Q2NKI2 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Vax1Q2NKI2 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Vax1Q2NKI2 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Vax1Q2NKI2 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Vax1Q2NKI2 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Vax1Q2NKI2 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Vax1Q2NKI2 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Vax1Q2NKI2 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Vax1Q2NKI2 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Vax1Q2NKI2 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Vax1Q2NKI2 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Vax1Q2NKI2 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Vax1Q2NKI2 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Vax1Q2NKI2 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Vax1Q2NKI2 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Vax1Q2NKI2 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Vax1Q2NKI2 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Vax1Q2NKI2 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Vax1Q2NKI2 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Vax1Q2NKI2 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Vax1Q2NKI2 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Vax1Q2NKI2 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Vax1Q2NKI2 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Vax1Q2NKI2 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Vax1Q2NKI2 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Vax1Q2NKI2 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Vax1Q2NKI2 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Vax1Q2NKI2 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Vax1Q2NKI2 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Vax1Q2NKI2 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Vax1Q2NKI2 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Vax1Q2NKI2 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Vax1Q2NKI2 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Vax1Q2NKI2 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Vax1Q2NKI2 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Vax1Q2NKI2 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms