Protein–RNA interactions for Protein: Q1ERP8

Cd300lg, CMRF35-like molecule 9, mousemouse

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd300lgQ1ERP8 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cd300lgQ1ERP8 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cd300lgQ1ERP8 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cd300lgQ1ERP8 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cd300lgQ1ERP8 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cd300lgQ1ERP8 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cd300lgQ1ERP8 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cd300lgQ1ERP8 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cd300lgQ1ERP8 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cd300lgQ1ERP8 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cd300lgQ1ERP8 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Cd300lgQ1ERP8 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cd300lgQ1ERP8 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cd300lgQ1ERP8 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cd300lgQ1ERP8 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cd300lgQ1ERP8 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cd300lgQ1ERP8 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cd300lgQ1ERP8 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cd300lgQ1ERP8 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Cd300lgQ1ERP8 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cd300lgQ1ERP8 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cd300lgQ1ERP8 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cd300lgQ1ERP8 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cd300lgQ1ERP8 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cd300lgQ1ERP8 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cd300lgQ1ERP8 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cd300lgQ1ERP8 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Cd300lgQ1ERP8 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cd300lgQ1ERP8 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cd300lgQ1ERP8 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cd300lgQ1ERP8 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cd300lgQ1ERP8 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cd300lgQ1ERP8 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cd300lgQ1ERP8 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cd300lgQ1ERP8 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cd300lgQ1ERP8 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cd300lgQ1ERP8 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cd300lgQ1ERP8 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cd300lgQ1ERP8 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Cd300lgQ1ERP8 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cd300lgQ1ERP8 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cd300lgQ1ERP8 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cd300lgQ1ERP8 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cd300lgQ1ERP8 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cd300lgQ1ERP8 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cd300lgQ1ERP8 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cd300lgQ1ERP8 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cd300lgQ1ERP8 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cd300lgQ1ERP8 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Cd300lgQ1ERP8 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cd300lgQ1ERP8 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cd300lgQ1ERP8 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cd300lgQ1ERP8 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cd300lgQ1ERP8 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cd300lgQ1ERP8 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cd300lgQ1ERP8 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Cd300lgQ1ERP8 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cd300lgQ1ERP8 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cd300lgQ1ERP8 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cd300lgQ1ERP8 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cd300lgQ1ERP8 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cd300lgQ1ERP8 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cd300lgQ1ERP8 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Cd300lgQ1ERP8 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cd300lgQ1ERP8 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cd300lgQ1ERP8 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cd300lgQ1ERP8 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cd300lgQ1ERP8 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cd300lgQ1ERP8 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cd300lgQ1ERP8 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cd300lgQ1ERP8 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cd300lgQ1ERP8 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cd300lgQ1ERP8 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Cd300lgQ1ERP8 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cd300lgQ1ERP8 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cd300lgQ1ERP8 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cd300lgQ1ERP8 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cd300lgQ1ERP8 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cd300lgQ1ERP8 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cd300lgQ1ERP8 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cd300lgQ1ERP8 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cd300lgQ1ERP8 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cd300lgQ1ERP8 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cd300lgQ1ERP8 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cd300lgQ1ERP8 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cd300lgQ1ERP8 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cd300lgQ1ERP8 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cd300lgQ1ERP8 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cd300lgQ1ERP8 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cd300lgQ1ERP8 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cd300lgQ1ERP8 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cd300lgQ1ERP8 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cd300lgQ1ERP8 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cd300lgQ1ERP8 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cd300lgQ1ERP8 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cd300lgQ1ERP8 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cd300lgQ1ERP8 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cd300lgQ1ERP8 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Cd300lgQ1ERP8 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cd300lgQ1ERP8 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
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