Protein–RNA interactions for Protein: Q14AI6

Rpusd3, Mitochondrial mRNA pseudouridine synthase Rpusd3, mousemouse

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Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd3Q14AI6 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rpusd3Q14AI6 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rpusd3Q14AI6 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rpusd3Q14AI6 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rpusd3Q14AI6 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rpusd3Q14AI6 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rpusd3Q14AI6 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rpusd3Q14AI6 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rpusd3Q14AI6 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rpusd3Q14AI6 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rpusd3Q14AI6 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rpusd3Q14AI6 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rpusd3Q14AI6 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rpusd3Q14AI6 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rpusd3Q14AI6 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rpusd3Q14AI6 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rpusd3Q14AI6 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rpusd3Q14AI6 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rpusd3Q14AI6 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rpusd3Q14AI6 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rpusd3Q14AI6 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rpusd3Q14AI6 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rpusd3Q14AI6 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rpusd3Q14AI6 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rpusd3Q14AI6 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rpusd3Q14AI6 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rpusd3Q14AI6 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rpusd3Q14AI6 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rpusd3Q14AI6 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rpusd3Q14AI6 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rpusd3Q14AI6 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rpusd3Q14AI6 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rpusd3Q14AI6 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rpusd3Q14AI6 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rpusd3Q14AI6 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rpusd3Q14AI6 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rpusd3Q14AI6 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rpusd3Q14AI6 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rpusd3Q14AI6 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rpusd3Q14AI6 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Rpusd3Q14AI6 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rpusd3Q14AI6 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rpusd3Q14AI6 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rpusd3Q14AI6 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rpusd3Q14AI6 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rpusd3Q14AI6 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rpusd3Q14AI6 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rpusd3Q14AI6 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rpusd3Q14AI6 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rpusd3Q14AI6 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Rpusd3Q14AI6 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rpusd3Q14AI6 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Rpusd3Q14AI6 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rpusd3Q14AI6 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rpusd3Q14AI6 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rpusd3Q14AI6 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rpusd3Q14AI6 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Rpusd3Q14AI6 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Rpusd3Q14AI6 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rpusd3Q14AI6 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rpusd3Q14AI6 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rpusd3Q14AI6 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rpusd3Q14AI6 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rpusd3Q14AI6 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rpusd3Q14AI6 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rpusd3Q14AI6 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rpusd3Q14AI6 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rpusd3Q14AI6 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rpusd3Q14AI6 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rpusd3Q14AI6 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rpusd3Q14AI6 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Rpusd3Q14AI6 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Rpusd3Q14AI6 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rpusd3Q14AI6 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rpusd3Q14AI6 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rpusd3Q14AI6 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rpusd3Q14AI6 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rpusd3Q14AI6 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rpusd3Q14AI6 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rpusd3Q14AI6 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rpusd3Q14AI6 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rpusd3Q14AI6 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rpusd3Q14AI6 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rpusd3Q14AI6 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rpusd3Q14AI6 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rpusd3Q14AI6 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rpusd3Q14AI6 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rpusd3Q14AI6 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Rpusd3Q14AI6 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rpusd3Q14AI6 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rpusd3Q14AI6 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rpusd3Q14AI6 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rpusd3Q14AI6 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rpusd3Q14AI6 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rpusd3Q14AI6 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rpusd3Q14AI6 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rpusd3Q14AI6 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rpusd3Q14AI6 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rpusd3Q14AI6 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rpusd3Q14AI6 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
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