Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Rpusd2Q149F1 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Rpusd2Q149F1 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Rpusd2Q149F1 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Rpusd2Q149F1 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Rpusd2Q149F1 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Rpusd2Q149F1 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Rpusd2Q149F1 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Rpusd2Q149F1 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Rpusd2Q149F1 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Rpusd2Q149F1 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
Rpusd2Q149F1 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
Rpusd2Q149F1 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Rpusd2Q149F1 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Rpusd2Q149F1 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Rpusd2Q149F1 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
Rpusd2Q149F1 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Rpusd2Q149F1 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Rpusd2Q149F1 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Rpusd2Q149F1 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Rpusd2Q149F1 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Rpusd2Q149F1 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Rpusd2Q149F1 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Rpusd2Q149F1 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Rpusd2Q149F1 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Rpusd2Q149F1 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Rpusd2Q149F1 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Rpusd2Q149F1 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
Rpusd2Q149F1 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
Rpusd2Q149F1 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Rpusd2Q149F1 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Rpusd2Q149F1 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Rpusd2Q149F1 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Rpusd2Q149F1 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Rpusd2Q149F1 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Rpusd2Q149F1 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Rpusd2Q149F1 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Rpusd2Q149F1 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Rpusd2Q149F1 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Rpusd2Q149F1 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Rpusd2Q149F1 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Rpusd2Q149F1 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Rpusd2Q149F1 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Rpusd2Q149F1 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Rpusd2Q149F1 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Rpusd2Q149F1 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Rpusd2Q149F1 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Rpusd2Q149F1 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Rpusd2Q149F1 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Rpusd2Q149F1 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Rpusd2Q149F1 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Rpusd2Q149F1 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Rpusd2Q149F1 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Rpusd2Q149F1 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Rpusd2Q149F1 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Rpusd2Q149F1 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Rpusd2Q149F1 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Rpusd2Q149F1 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Rpusd2Q149F1 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
Rpusd2Q149F1 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Rpusd2Q149F1 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Rpusd2Q149F1 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Rpusd2Q149F1 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Rpusd2Q149F1 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Rpusd2Q149F1 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Rpusd2Q149F1 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
Rpusd2Q149F1 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Rpusd2Q149F1 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Rpusd2Q149F1 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Rpusd2Q149F1 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Rpusd2Q149F1 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Rpusd2Q149F1 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Rpusd2Q149F1 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Rpusd2Q149F1 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Rpusd2Q149F1 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Rpusd2Q149F1 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Rpusd2Q149F1 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Rpusd2Q149F1 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Rpusd2Q149F1 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Rpusd2Q149F1 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Rpusd2Q149F1 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Rpusd2Q149F1 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Rpusd2Q149F1 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Rpusd2Q149F1 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Rpusd2Q149F1 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Rpusd2Q149F1 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Rpusd2Q149F1 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Rpusd2Q149F1 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Rpusd2Q149F1 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Rpusd2Q149F1 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Rpusd2Q149F1 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Rpusd2Q149F1 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Rpusd2Q149F1 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Rpusd2Q149F1 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Rpusd2Q149F1 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Rpusd2Q149F1 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Rpusd2Q149F1 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Rpusd2Q149F1 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Rpusd2Q149F1 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Rpusd2Q149F1 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
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