Protein–RNA interactions for Protein: Q08460

Kcnma1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnma1Q08460 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Kcnma1Q08460 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Kcnma1Q08460 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Kcnma1Q08460 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Kcnma1Q08460 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Kcnma1Q08460 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Kcnma1Q08460 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Kcnma1Q08460 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Kcnma1Q08460 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
Kcnma1Q08460 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Kcnma1Q08460 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Kcnma1Q08460 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Kcnma1Q08460 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Kcnma1Q08460 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Kcnma1Q08460 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Kcnma1Q08460 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Kcnma1Q08460 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Kcnma1Q08460 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Kcnma1Q08460 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Kcnma1Q08460 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Kcnma1Q08460 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Kcnma1Q08460 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Kcnma1Q08460 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Kcnma1Q08460 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Kcnma1Q08460 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Kcnma1Q08460 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Kcnma1Q08460 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Kcnma1Q08460 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Kcnma1Q08460 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Kcnma1Q08460 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Kcnma1Q08460 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Kcnma1Q08460 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Kcnma1Q08460 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Kcnma1Q08460 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Kcnma1Q08460 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Kcnma1Q08460 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Kcnma1Q08460 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Kcnma1Q08460 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Kcnma1Q08460 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Kcnma1Q08460 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Kcnma1Q08460 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Kcnma1Q08460 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Kcnma1Q08460 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Kcnma1Q08460 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Kcnma1Q08460 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Kcnma1Q08460 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Kcnma1Q08460 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Kcnma1Q08460 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Kcnma1Q08460 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Kcnma1Q08460 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Kcnma1Q08460 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Kcnma1Q08460 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Kcnma1Q08460 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Kcnma1Q08460 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Kcnma1Q08460 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Kcnma1Q08460 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Kcnma1Q08460 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Kcnma1Q08460 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Kcnma1Q08460 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Kcnma1Q08460 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Kcnma1Q08460 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Kcnma1Q08460 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Kcnma1Q08460 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Kcnma1Q08460 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Kcnma1Q08460 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Kcnma1Q08460 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Kcnma1Q08460 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Kcnma1Q08460 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Kcnma1Q08460 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Kcnma1Q08460 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Kcnma1Q08460 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Kcnma1Q08460 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Kcnma1Q08460 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Kcnma1Q08460 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Kcnma1Q08460 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Kcnma1Q08460 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Kcnma1Q08460 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Kcnma1Q08460 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Kcnma1Q08460 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Kcnma1Q08460 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
Kcnma1Q08460 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Kcnma1Q08460 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Kcnma1Q08460 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Kcnma1Q08460 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Kcnma1Q08460 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Kcnma1Q08460 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Kcnma1Q08460 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Kcnma1Q08460 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Kcnma1Q08460 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Kcnma1Q08460 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Kcnma1Q08460 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Kcnma1Q08460 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Kcnma1Q08460 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
Kcnma1Q08460 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Kcnma1Q08460 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Kcnma1Q08460 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Kcnma1Q08460 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Kcnma1Q08460 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Kcnma1Q08460 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Kcnma1Q08460 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms