Protein–RNA interactions for Protein: Q08297

Rad51, DNA repair protein RAD51 homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad51Q08297 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rad51Q08297 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Rad51Q08297 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rad51Q08297 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rad51Q08297 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rad51Q08297 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rad51Q08297 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rad51Q08297 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rad51Q08297 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rad51Q08297 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rad51Q08297 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rad51Q08297 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Rad51Q08297 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rad51Q08297 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rad51Q08297 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rad51Q08297 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rad51Q08297 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rad51Q08297 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rad51Q08297 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rad51Q08297 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rad51Q08297 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rad51Q08297 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rad51Q08297 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rad51Q08297 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rad51Q08297 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rad51Q08297 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rad51Q08297 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Rad51Q08297 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rad51Q08297 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rad51Q08297 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rad51Q08297 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rad51Q08297 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rad51Q08297 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rad51Q08297 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rad51Q08297 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rad51Q08297 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rad51Q08297 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rad51Q08297 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Rad51Q08297 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rad51Q08297 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rad51Q08297 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rad51Q08297 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rad51Q08297 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Rad51Q08297 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rad51Q08297 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rad51Q08297 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rad51Q08297 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rad51Q08297 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rad51Q08297 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rad51Q08297 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rad51Q08297 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rad51Q08297 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rad51Q08297 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rad51Q08297 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rad51Q08297 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rad51Q08297 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rad51Q08297 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rad51Q08297 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rad51Q08297 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rad51Q08297 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rad51Q08297 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rad51Q08297 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rad51Q08297 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rad51Q08297 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rad51Q08297 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rad51Q08297 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rad51Q08297 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rad51Q08297 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rad51Q08297 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rad51Q08297 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rad51Q08297 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rad51Q08297 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rad51Q08297 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rad51Q08297 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rad51Q08297 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rad51Q08297 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Rad51Q08297 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rad51Q08297 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rad51Q08297 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rad51Q08297 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rad51Q08297 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rad51Q08297 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rad51Q08297 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rad51Q08297 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rad51Q08297 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rad51Q08297 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rad51Q08297 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rad51Q08297 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rad51Q08297 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rad51Q08297 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rad51Q08297 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rad51Q08297 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rad51Q08297 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rad51Q08297 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rad51Q08297 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rad51Q08297 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Rad51Q08297 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rad51Q08297 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Rad51Q08297 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Rad51Q08297 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms