Protein–RNA interactions for Protein: Q08189

Tgm3, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase E, mousemouse

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgm3Q08189 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tgm3Q08189 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tgm3Q08189 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tgm3Q08189 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tgm3Q08189 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tgm3Q08189 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tgm3Q08189 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tgm3Q08189 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Tgm3Q08189 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tgm3Q08189 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tgm3Q08189 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tgm3Q08189 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tgm3Q08189 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tgm3Q08189 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tgm3Q08189 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tgm3Q08189 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Tgm3Q08189 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tgm3Q08189 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tgm3Q08189 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tgm3Q08189 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tgm3Q08189 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tgm3Q08189 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Tgm3Q08189 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tgm3Q08189 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tgm3Q08189 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tgm3Q08189 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tgm3Q08189 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tgm3Q08189 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Tgm3Q08189 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tgm3Q08189 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tgm3Q08189 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tgm3Q08189 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tgm3Q08189 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tgm3Q08189 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tgm3Q08189 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Tgm3Q08189 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tgm3Q08189 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Tgm3Q08189 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tgm3Q08189 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tgm3Q08189 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tgm3Q08189 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tgm3Q08189 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tgm3Q08189 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tgm3Q08189 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tgm3Q08189 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tgm3Q08189 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tgm3Q08189 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tgm3Q08189 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tgm3Q08189 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tgm3Q08189 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tgm3Q08189 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tgm3Q08189 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tgm3Q08189 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tgm3Q08189 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tgm3Q08189 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Tgm3Q08189 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Tgm3Q08189 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Tgm3Q08189 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tgm3Q08189 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tgm3Q08189 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tgm3Q08189 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tgm3Q08189 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tgm3Q08189 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tgm3Q08189 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tgm3Q08189 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tgm3Q08189 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tgm3Q08189 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tgm3Q08189 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tgm3Q08189 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tgm3Q08189 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tgm3Q08189 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tgm3Q08189 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Tgm3Q08189 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tgm3Q08189 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tgm3Q08189 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tgm3Q08189 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tgm3Q08189 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tgm3Q08189 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Tgm3Q08189 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tgm3Q08189 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tgm3Q08189 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tgm3Q08189 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tgm3Q08189 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tgm3Q08189 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tgm3Q08189 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tgm3Q08189 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tgm3Q08189 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tgm3Q08189 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tgm3Q08189 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tgm3Q08189 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tgm3Q08189 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tgm3Q08189 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Tgm3Q08189 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tgm3Q08189 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tgm3Q08189 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tgm3Q08189 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tgm3Q08189 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Tgm3Q08189 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tgm3Q08189 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tgm3Q08189 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms