Protein–RNA interactions for Protein: Q07797

Lgals3bp, Galectin-3-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 577 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lgals3bpQ07797 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Lgals3bpQ07797 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Lgals3bpQ07797 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Lgals3bpQ07797 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Lgals3bpQ07797 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Lgals3bpQ07797 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Lgals3bpQ07797 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Lgals3bpQ07797 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Lgals3bpQ07797 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Lgals3bpQ07797 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Lgals3bpQ07797 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Lgals3bpQ07797 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Lgals3bpQ07797 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Lgals3bpQ07797 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Lgals3bpQ07797 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Lgals3bpQ07797 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lgals3bpQ07797 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lgals3bpQ07797 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lgals3bpQ07797 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Lgals3bpQ07797 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Lgals3bpQ07797 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Lgals3bpQ07797 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Lgals3bpQ07797 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Lgals3bpQ07797 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Lgals3bpQ07797 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lgals3bpQ07797 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lgals3bpQ07797 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lgals3bpQ07797 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lgals3bpQ07797 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lgals3bpQ07797 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Lgals3bpQ07797 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Lgals3bpQ07797 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Lgals3bpQ07797 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lgals3bpQ07797 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lgals3bpQ07797 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lgals3bpQ07797 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Lgals3bpQ07797 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lgals3bpQ07797 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lgals3bpQ07797 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lgals3bpQ07797 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lgals3bpQ07797 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lgals3bpQ07797 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Lgals3bpQ07797 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lgals3bpQ07797 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lgals3bpQ07797 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lgals3bpQ07797 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lgals3bpQ07797 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lgals3bpQ07797 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lgals3bpQ07797 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Lgals3bpQ07797 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lgals3bpQ07797 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lgals3bpQ07797 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lgals3bpQ07797 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Lgals3bpQ07797 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Lgals3bpQ07797 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lgals3bpQ07797 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lgals3bpQ07797 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lgals3bpQ07797 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Lgals3bpQ07797 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lgals3bpQ07797 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lgals3bpQ07797 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lgals3bpQ07797 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lgals3bpQ07797 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lgals3bpQ07797 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lgals3bpQ07797 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lgals3bpQ07797 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lgals3bpQ07797 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lgals3bpQ07797 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lgals3bpQ07797 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lgals3bpQ07797 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lgals3bpQ07797 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lgals3bpQ07797 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Lgals3bpQ07797 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lgals3bpQ07797 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lgals3bpQ07797 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lgals3bpQ07797 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lgals3bpQ07797 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Lgals3bpQ07797 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Lgals3bpQ07797 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Lgals3bpQ07797 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Lgals3bpQ07797 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lgals3bpQ07797 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lgals3bpQ07797 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lgals3bpQ07797 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lgals3bpQ07797 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lgals3bpQ07797 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lgals3bpQ07797 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lgals3bpQ07797 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lgals3bpQ07797 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Lgals3bpQ07797 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lgals3bpQ07797 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lgals3bpQ07797 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lgals3bpQ07797 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lgals3bpQ07797 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Lgals3bpQ07797 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Lgals3bpQ07797 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Lgals3bpQ07797 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lgals3bpQ07797 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lgals3bpQ07797 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lgals3bpQ07797 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms