Protein–RNA interactions for Protein: Q07104

Gdf3, Growth/differentiation factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf3Q07104 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gdf3Q07104 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gdf3Q07104 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gdf3Q07104 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gdf3Q07104 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gdf3Q07104 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gdf3Q07104 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Gdf3Q07104 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gdf3Q07104 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gdf3Q07104 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gdf3Q07104 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gdf3Q07104 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gdf3Q07104 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gdf3Q07104 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gdf3Q07104 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gdf3Q07104 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gdf3Q07104 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gdf3Q07104 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gdf3Q07104 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gdf3Q07104 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gdf3Q07104 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gdf3Q07104 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gdf3Q07104 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gdf3Q07104 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gdf3Q07104 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gdf3Q07104 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Gdf3Q07104 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gdf3Q07104 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gdf3Q07104 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gdf3Q07104 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gdf3Q07104 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gdf3Q07104 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gdf3Q07104 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gdf3Q07104 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gdf3Q07104 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gdf3Q07104 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gdf3Q07104 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gdf3Q07104 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gdf3Q07104 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gdf3Q07104 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gdf3Q07104 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Gdf3Q07104 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gdf3Q07104 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gdf3Q07104 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Gdf3Q07104 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gdf3Q07104 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gdf3Q07104 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gdf3Q07104 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gdf3Q07104 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gdf3Q07104 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Gdf3Q07104 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gdf3Q07104 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gdf3Q07104 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gdf3Q07104 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gdf3Q07104 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gdf3Q07104 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gdf3Q07104 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gdf3Q07104 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Gdf3Q07104 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gdf3Q07104 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gdf3Q07104 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gdf3Q07104 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gdf3Q07104 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gdf3Q07104 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gdf3Q07104 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gdf3Q07104 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Gdf3Q07104 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gdf3Q07104 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gdf3Q07104 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gdf3Q07104 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gdf3Q07104 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gdf3Q07104 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Gdf3Q07104 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Gdf3Q07104 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Gdf3Q07104 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gdf3Q07104 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gdf3Q07104 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gdf3Q07104 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gdf3Q07104 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gdf3Q07104 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gdf3Q07104 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gdf3Q07104 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gdf3Q07104 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gdf3Q07104 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gdf3Q07104 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gdf3Q07104 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gdf3Q07104 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gdf3Q07104 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gdf3Q07104 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gdf3Q07104 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gdf3Q07104 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Gdf3Q07104 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gdf3Q07104 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gdf3Q07104 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gdf3Q07104 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gdf3Q07104 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gdf3Q07104 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Gdf3Q07104 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Gdf3Q07104 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gdf3Q07104 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms