Protein–RNA interactions for Protein: Q06666

Srst, Octapeptide-repeat protein T2, mousemouse

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrstQ06666 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SrstQ06666 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SrstQ06666 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SrstQ06666 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SrstQ06666 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SrstQ06666 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SrstQ06666 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SrstQ06666 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SrstQ06666 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SrstQ06666 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SrstQ06666 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SrstQ06666 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SrstQ06666 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SrstQ06666 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SrstQ06666 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SrstQ06666 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SrstQ06666 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SrstQ06666 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SrstQ06666 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SrstQ06666 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SrstQ06666 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SrstQ06666 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SrstQ06666 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SrstQ06666 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SrstQ06666 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SrstQ06666 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SrstQ06666 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SrstQ06666 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SrstQ06666 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SrstQ06666 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SrstQ06666 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SrstQ06666 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SrstQ06666 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SrstQ06666 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SrstQ06666 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SrstQ06666 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SrstQ06666 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SrstQ06666 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SrstQ06666 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SrstQ06666 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SrstQ06666 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SrstQ06666 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SrstQ06666 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SrstQ06666 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SrstQ06666 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SrstQ06666 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SrstQ06666 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SrstQ06666 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SrstQ06666 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SrstQ06666 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
SrstQ06666 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SrstQ06666 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SrstQ06666 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SrstQ06666 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SrstQ06666 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SrstQ06666 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SrstQ06666 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SrstQ06666 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SrstQ06666 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SrstQ06666 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SrstQ06666 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SrstQ06666 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SrstQ06666 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SrstQ06666 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SrstQ06666 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SrstQ06666 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
SrstQ06666 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SrstQ06666 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SrstQ06666 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SrstQ06666 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SrstQ06666 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SrstQ06666 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SrstQ06666 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SrstQ06666 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SrstQ06666 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SrstQ06666 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SrstQ06666 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SrstQ06666 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SrstQ06666 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SrstQ06666 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SrstQ06666 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SrstQ06666 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SrstQ06666 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SrstQ06666 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SrstQ06666 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SrstQ06666 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SrstQ06666 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SrstQ06666 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SrstQ06666 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SrstQ06666 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SrstQ06666 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SrstQ06666 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SrstQ06666 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SrstQ06666 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SrstQ06666 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SrstQ06666 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SrstQ06666 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SrstQ06666 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SrstQ06666 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SrstQ06666 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms