Protein–RNA interactions for Protein: Q06138

Cab39, Calcium-binding protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cab39Q06138 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cab39Q06138 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cab39Q06138 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cab39Q06138 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cab39Q06138 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cab39Q06138 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cab39Q06138 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cab39Q06138 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cab39Q06138 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cab39Q06138 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cab39Q06138 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cab39Q06138 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cab39Q06138 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cab39Q06138 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cab39Q06138 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cab39Q06138 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cab39Q06138 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cab39Q06138 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cab39Q06138 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cab39Q06138 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cab39Q06138 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cab39Q06138 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cab39Q06138 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cab39Q06138 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cab39Q06138 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cab39Q06138 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cab39Q06138 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cab39Q06138 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cab39Q06138 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cab39Q06138 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cab39Q06138 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cab39Q06138 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cab39Q06138 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cab39Q06138 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cab39Q06138 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cab39Q06138 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cab39Q06138 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cab39Q06138 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cab39Q06138 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cab39Q06138 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cab39Q06138 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cab39Q06138 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cab39Q06138 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cab39Q06138 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cab39Q06138 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cab39Q06138 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cab39Q06138 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cab39Q06138 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cab39Q06138 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cab39Q06138 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cab39Q06138 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cab39Q06138 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cab39Q06138 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cab39Q06138 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cab39Q06138 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Cab39Q06138 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cab39Q06138 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cab39Q06138 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Cab39Q06138 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cab39Q06138 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cab39Q06138 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Cab39Q06138 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Cab39Q06138 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cab39Q06138 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cab39Q06138 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cab39Q06138 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Cab39Q06138 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cab39Q06138 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Cab39Q06138 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cab39Q06138 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Cab39Q06138 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Cab39Q06138 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cab39Q06138 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cab39Q06138 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cab39Q06138 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Cab39Q06138 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cab39Q06138 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cab39Q06138 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cab39Q06138 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Cab39Q06138 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Cab39Q06138 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Cab39Q06138 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cab39Q06138 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cab39Q06138 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cab39Q06138 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cab39Q06138 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cab39Q06138 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Cab39Q06138 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cab39Q06138 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cab39Q06138 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cab39Q06138 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cab39Q06138 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cab39Q06138 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cab39Q06138 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cab39Q06138 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cab39Q06138 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cab39Q06138 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cab39Q06138 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cab39Q06138 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cab39Q06138 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms