Protein–RNA interactions for Protein: Q04888

Sox10, Transcription factor SOX-10, mousemouse

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox10Q04888 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Sox10Q04888 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Sox10Q04888 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Sox10Q04888 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Sox10Q04888 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Sox10Q04888 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Sox10Q04888 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Sox10Q04888 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Sox10Q04888 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Sox10Q04888 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Sox10Q04888 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Sox10Q04888 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
Sox10Q04888 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Sox10Q04888 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Sox10Q04888 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Sox10Q04888 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Sox10Q04888 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
Sox10Q04888 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Sox10Q04888 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Sox10Q04888 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Sox10Q04888 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Sox10Q04888 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Sox10Q04888 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Sox10Q04888 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Sox10Q04888 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Sox10Q04888 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Sox10Q04888 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Sox10Q04888 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Sox10Q04888 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Sox10Q04888 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
Sox10Q04888 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Sox10Q04888 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Sox10Q04888 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Sox10Q04888 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Sox10Q04888 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Sox10Q04888 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Sox10Q04888 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Sox10Q04888 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Sox10Q04888 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Sox10Q04888 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Sox10Q04888 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Sox10Q04888 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Sox10Q04888 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Sox10Q04888 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Sox10Q04888 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Sox10Q04888 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Sox10Q04888 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
Sox10Q04888 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Sox10Q04888 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Sox10Q04888 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
Sox10Q04888 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Sox10Q04888 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Sox10Q04888 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Sox10Q04888 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Sox10Q04888 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Sox10Q04888 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Sox10Q04888 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Sox10Q04888 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Sox10Q04888 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Sox10Q04888 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Sox10Q04888 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Sox10Q04888 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Sox10Q04888 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Sox10Q04888 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Sox10Q04888 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Sox10Q04888 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Sox10Q04888 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Sox10Q04888 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Sox10Q04888 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Sox10Q04888 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Sox10Q04888 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Sox10Q04888 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Sox10Q04888 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Sox10Q04888 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Sox10Q04888 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
Sox10Q04888 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Sox10Q04888 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Sox10Q04888 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Sox10Q04888 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Sox10Q04888 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Sox10Q04888 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
Sox10Q04888 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Sox10Q04888 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Sox10Q04888 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Sox10Q04888 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Sox10Q04888 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Sox10Q04888 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Sox10Q04888 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Sox10Q04888 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Sox10Q04888 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Sox10Q04888 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Sox10Q04888 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
Sox10Q04888 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Sox10Q04888 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
Sox10Q04888 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Sox10Q04888 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Sox10Q04888 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Sox10Q04888 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
Sox10Q04888 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Sox10Q04888 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms