Protein–RNA interactions for Protein: Q04886

Sox8, Transcription factor SOX-8, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox8Q04886 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Sox8Q04886 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Sox8Q04886 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Sox8Q04886 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Sox8Q04886 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Sox8Q04886 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Sox8Q04886 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Sox8Q04886 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Sox8Q04886 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Sox8Q04886 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Sox8Q04886 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Sox8Q04886 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Sox8Q04886 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Sox8Q04886 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Sox8Q04886 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Sox8Q04886 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Sox8Q04886 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Sox8Q04886 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Sox8Q04886 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Sox8Q04886 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Sox8Q04886 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Sox8Q04886 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Sox8Q04886 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Sox8Q04886 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Sox8Q04886 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Sox8Q04886 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Sox8Q04886 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Sox8Q04886 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Sox8Q04886 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Sox8Q04886 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Sox8Q04886 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Sox8Q04886 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Sox8Q04886 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Sox8Q04886 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Sox8Q04886 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Sox8Q04886 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Sox8Q04886 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Sox8Q04886 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Sox8Q04886 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Sox8Q04886 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Sox8Q04886 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Sox8Q04886 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Sox8Q04886 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Sox8Q04886 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Sox8Q04886 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Sox8Q04886 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Sox8Q04886 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Sox8Q04886 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Sox8Q04886 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Sox8Q04886 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Sox8Q04886 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Sox8Q04886 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Sox8Q04886 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Sox8Q04886 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Sox8Q04886 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Sox8Q04886 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Sox8Q04886 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Sox8Q04886 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Sox8Q04886 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Sox8Q04886 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Sox8Q04886 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Sox8Q04886 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Sox8Q04886 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Sox8Q04886 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Sox8Q04886 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Sox8Q04886 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Sox8Q04886 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Sox8Q04886 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Sox8Q04886 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Sox8Q04886 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Sox8Q04886 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Sox8Q04886 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Sox8Q04886 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Sox8Q04886 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Sox8Q04886 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Sox8Q04886 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Sox8Q04886 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Sox8Q04886 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Sox8Q04886 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Sox8Q04886 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Sox8Q04886 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Sox8Q04886 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Sox8Q04886 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Sox8Q04886 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Sox8Q04886 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Sox8Q04886 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Sox8Q04886 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Sox8Q04886 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Sox8Q04886 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Sox8Q04886 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Sox8Q04886 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Sox8Q04886 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Sox8Q04886 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Sox8Q04886 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Sox8Q04886 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Sox8Q04886 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Sox8Q04886 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Sox8Q04886 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Sox8Q04886 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Sox8Q04886 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms