Protein–RNA interactions for Protein: Q03717

Kcnb1, Potassium voltage-gated channel subfamily B member 1, mousemouse

Predictions only

Length 857 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnb1Q03717 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Kcnb1Q03717 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Kcnb1Q03717 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Kcnb1Q03717 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Kcnb1Q03717 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Kcnb1Q03717 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Kcnb1Q03717 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Kcnb1Q03717 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Kcnb1Q03717 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Kcnb1Q03717 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Kcnb1Q03717 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Kcnb1Q03717 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Kcnb1Q03717 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Kcnb1Q03717 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Kcnb1Q03717 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Kcnb1Q03717 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Kcnb1Q03717 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Kcnb1Q03717 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Kcnb1Q03717 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Kcnb1Q03717 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Kcnb1Q03717 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Kcnb1Q03717 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Kcnb1Q03717 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Kcnb1Q03717 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Kcnb1Q03717 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Kcnb1Q03717 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Kcnb1Q03717 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Kcnb1Q03717 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Kcnb1Q03717 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Kcnb1Q03717 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Kcnb1Q03717 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Kcnb1Q03717 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Kcnb1Q03717 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Kcnb1Q03717 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Kcnb1Q03717 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Kcnb1Q03717 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Kcnb1Q03717 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Kcnb1Q03717 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Kcnb1Q03717 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Kcnb1Q03717 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Kcnb1Q03717 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Kcnb1Q03717 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
Kcnb1Q03717 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Kcnb1Q03717 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Kcnb1Q03717 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Kcnb1Q03717 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Kcnb1Q03717 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Kcnb1Q03717 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Kcnb1Q03717 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Kcnb1Q03717 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Kcnb1Q03717 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Kcnb1Q03717 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Kcnb1Q03717 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Kcnb1Q03717 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Kcnb1Q03717 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Kcnb1Q03717 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Kcnb1Q03717 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Kcnb1Q03717 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Kcnb1Q03717 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Kcnb1Q03717 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Kcnb1Q03717 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Kcnb1Q03717 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Kcnb1Q03717 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Kcnb1Q03717 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Kcnb1Q03717 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Kcnb1Q03717 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Kcnb1Q03717 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Kcnb1Q03717 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Kcnb1Q03717 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Kcnb1Q03717 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Kcnb1Q03717 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Kcnb1Q03717 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Kcnb1Q03717 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Kcnb1Q03717 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Kcnb1Q03717 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Kcnb1Q03717 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Kcnb1Q03717 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Kcnb1Q03717 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Kcnb1Q03717 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Kcnb1Q03717 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Kcnb1Q03717 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Kcnb1Q03717 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Kcnb1Q03717 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Kcnb1Q03717 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Kcnb1Q03717 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Kcnb1Q03717 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Kcnb1Q03717 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Kcnb1Q03717 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Kcnb1Q03717 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Kcnb1Q03717 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Kcnb1Q03717 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Kcnb1Q03717 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Kcnb1Q03717 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Kcnb1Q03717 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Kcnb1Q03717 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Kcnb1Q03717 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Kcnb1Q03717 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Kcnb1Q03717 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Kcnb1Q03717 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Kcnb1Q03717 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 181.2 ms