Protein–RNA interactions for Protein: Q03358

Msx2, Homeobox protein MSX-2, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx2Q03358 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Msx2Q03358 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Msx2Q03358 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Msx2Q03358 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Msx2Q03358 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Msx2Q03358 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Msx2Q03358 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Msx2Q03358 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Msx2Q03358 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Msx2Q03358 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Msx2Q03358 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Msx2Q03358 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Msx2Q03358 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Msx2Q03358 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Msx2Q03358 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Msx2Q03358 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Msx2Q03358 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Msx2Q03358 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Msx2Q03358 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Msx2Q03358 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Msx2Q03358 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Msx2Q03358 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Msx2Q03358 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Msx2Q03358 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Msx2Q03358 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Msx2Q03358 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Msx2Q03358 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Msx2Q03358 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Msx2Q03358 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Msx2Q03358 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Msx2Q03358 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Msx2Q03358 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Msx2Q03358 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Msx2Q03358 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Msx2Q03358 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Msx2Q03358 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Msx2Q03358 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Msx2Q03358 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Msx2Q03358 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Msx2Q03358 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Msx2Q03358 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Msx2Q03358 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Msx2Q03358 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Msx2Q03358 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Msx2Q03358 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Msx2Q03358 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Msx2Q03358 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Msx2Q03358 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Msx2Q03358 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Msx2Q03358 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Msx2Q03358 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Msx2Q03358 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Msx2Q03358 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Msx2Q03358 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Msx2Q03358 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Msx2Q03358 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Msx2Q03358 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Msx2Q03358 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Msx2Q03358 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Msx2Q03358 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Msx2Q03358 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Msx2Q03358 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Msx2Q03358 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Msx2Q03358 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Msx2Q03358 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Msx2Q03358 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Msx2Q03358 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Msx2Q03358 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Msx2Q03358 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Msx2Q03358 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Msx2Q03358 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Msx2Q03358 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Msx2Q03358 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Msx2Q03358 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Msx2Q03358 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Msx2Q03358 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Msx2Q03358 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Msx2Q03358 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Msx2Q03358 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Msx2Q03358 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Msx2Q03358 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Msx2Q03358 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Msx2Q03358 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Msx2Q03358 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Msx2Q03358 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Msx2Q03358 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Msx2Q03358 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Msx2Q03358 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Msx2Q03358 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Msx2Q03358 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Msx2Q03358 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Msx2Q03358 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Msx2Q03358 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Msx2Q03358 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Msx2Q03358 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Msx2Q03358 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Msx2Q03358 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Msx2Q03358 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Msx2Q03358 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Msx2Q03358 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 102.7 ms