Protein–RNA interactions for Protein: Q02853

Mmp11, Stromelysin-3, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp11Q02853 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Mmp11Q02853 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Mmp11Q02853 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Mmp11Q02853 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Mmp11Q02853 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Mmp11Q02853 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Mmp11Q02853 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Mmp11Q02853 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Mmp11Q02853 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Mmp11Q02853 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Mmp11Q02853 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Mmp11Q02853 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Mmp11Q02853 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Mmp11Q02853 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Mmp11Q02853 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Mmp11Q02853 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Mmp11Q02853 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Mmp11Q02853 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Mmp11Q02853 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Mmp11Q02853 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Mmp11Q02853 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Mmp11Q02853 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Mmp11Q02853 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Mmp11Q02853 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Mmp11Q02853 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Mmp11Q02853 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Mmp11Q02853 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Mmp11Q02853 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Mmp11Q02853 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Mmp11Q02853 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Mmp11Q02853 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Mmp11Q02853 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Mmp11Q02853 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Mmp11Q02853 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Mmp11Q02853 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Mmp11Q02853 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Mmp11Q02853 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Mmp11Q02853 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Mmp11Q02853 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Mmp11Q02853 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Mmp11Q02853 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Mmp11Q02853 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Mmp11Q02853 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Mmp11Q02853 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Mmp11Q02853 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Mmp11Q02853 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Mmp11Q02853 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Mmp11Q02853 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Mmp11Q02853 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Mmp11Q02853 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Mmp11Q02853 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Mmp11Q02853 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Mmp11Q02853 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Mmp11Q02853 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Mmp11Q02853 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Mmp11Q02853 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Mmp11Q02853 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Mmp11Q02853 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Mmp11Q02853 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Mmp11Q02853 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Mmp11Q02853 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Mmp11Q02853 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Mmp11Q02853 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Mmp11Q02853 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Mmp11Q02853 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Mmp11Q02853 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Mmp11Q02853 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Mmp11Q02853 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Mmp11Q02853 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Mmp11Q02853 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Mmp11Q02853 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Mmp11Q02853 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Mmp11Q02853 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Mmp11Q02853 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Mmp11Q02853 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Mmp11Q02853 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Mmp11Q02853 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Mmp11Q02853 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Mmp11Q02853 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Mmp11Q02853 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Mmp11Q02853 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Mmp11Q02853 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Mmp11Q02853 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Mmp11Q02853 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Mmp11Q02853 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Mmp11Q02853 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Mmp11Q02853 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Mmp11Q02853 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Mmp11Q02853 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Mmp11Q02853 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Mmp11Q02853 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Mmp11Q02853 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Mmp11Q02853 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Mmp11Q02853 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Mmp11Q02853 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Mmp11Q02853 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Mmp11Q02853 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Mmp11Q02853 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Mmp11Q02853 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Mmp11Q02853 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 103.9 ms