Protein–RNA interactions for Protein: Q02789

Cacna1s, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, mousemouse

Predictions only

Length 1,880 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1sQ02789 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,5■■■□□ 2,63
Cacna1sQ02789 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,5■■■□□ 2,63
Cacna1sQ02789 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC31,49■■■□□ 2,63
Cacna1sQ02789 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,47■■■□□ 2,63
Cacna1sQ02789 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31,47■■■□□ 2,63
Cacna1sQ02789 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC31,47■■■□□ 2,63
Cacna1sQ02789 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC31,47■■■□□ 2,63
Cacna1sQ02789 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC31,47■■■□□ 2,63
Cacna1sQ02789 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,46■■■□□ 2,63
Cacna1sQ02789 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC31,45■■■□□ 2,63
Cacna1sQ02789 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31,45■■■□□ 2,63
Cacna1sQ02789 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC31,45■■■□□ 2,62
Cacna1sQ02789 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,45■■■□□ 2,62
Cacna1sQ02789 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC31,43■■■□□ 2,62
Cacna1sQ02789 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC31,43■■■□□ 2,62
Cacna1sQ02789 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,43■■■□□ 2,62
Cacna1sQ02789 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,43■■■□□ 2,62
Cacna1sQ02789 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,42■■■□□ 2,62
Cacna1sQ02789 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31,41■■■□□ 2,62
Cacna1sQ02789 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31,41■■■□□ 2,62
Cacna1sQ02789 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC31,4■■■□□ 2,62
Cacna1sQ02789 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC31,4■■■□□ 2,62
Cacna1sQ02789 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC31,4■■■□□ 2,62
Cacna1sQ02789 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,39■■■□□ 2,62
Cacna1sQ02789 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,39■■■□□ 2,62
Cacna1sQ02789 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,39■■■□□ 2,62
Cacna1sQ02789 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,38■■■□□ 2,61
Cacna1sQ02789 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC31,38■■■□□ 2,61
Cacna1sQ02789 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC31,35■■■□□ 2,61
Cacna1sQ02789 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC31,33■■■□□ 2,61
Cacna1sQ02789 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,33■■■□□ 2,61
Cacna1sQ02789 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31,33■■■□□ 2,61
Cacna1sQ02789 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC31,33■■■□□ 2,61
Cacna1sQ02789 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31,32■■■□□ 2,6
Cacna1sQ02789 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,3■■■□□ 2,6
Cacna1sQ02789 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC31,3■■■□□ 2,6
Cacna1sQ02789 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31,29■■■□□ 2,6
Cacna1sQ02789 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,29■■■□□ 2,6
Cacna1sQ02789 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,29■■■□□ 2,6
Cacna1sQ02789 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31,29■■■□□ 2,6
Cacna1sQ02789 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31,28■■■□□ 2,6
Cacna1sQ02789 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC31,28■■■□□ 2,6
Cacna1sQ02789 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC31,27■■■□□ 2,6
Cacna1sQ02789 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,26■■■□□ 2,6
Cacna1sQ02789 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,26■■■□□ 2,59
Cacna1sQ02789 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC31,25■■■□□ 2,59
Cacna1sQ02789 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,24■■■□□ 2,59
Cacna1sQ02789 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC31,23■■■□□ 2,59
Cacna1sQ02789 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31,23■■■□□ 2,59
Cacna1sQ02789 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC31,23■■■□□ 2,59
Cacna1sQ02789 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,22■■■□□ 2,59
Cacna1sQ02789 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC31,21■■■□□ 2,59
Cacna1sQ02789 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC31,21■■■□□ 2,59
Cacna1sQ02789 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31,21■■■□□ 2,59
Cacna1sQ02789 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC31,21■■■□□ 2,59
Cacna1sQ02789 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC31,2■■■□□ 2,58
Cacna1sQ02789 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,19■■■□□ 2,58
Cacna1sQ02789 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC31,19■■■□□ 2,58
Cacna1sQ02789 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC31,18■■■□□ 2,58
Cacna1sQ02789 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,18■■■□□ 2,58
Cacna1sQ02789 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,18■■■□□ 2,58
Cacna1sQ02789 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,18■■■□□ 2,58
Cacna1sQ02789 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31,18■■■□□ 2,58
Cacna1sQ02789 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,18■■■□□ 2,58
Cacna1sQ02789 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,18■■■□□ 2,58
Cacna1sQ02789 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC31,17■■■□□ 2,58
Cacna1sQ02789 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,16■■■□□ 2,58
Cacna1sQ02789 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,16■■■□□ 2,58
Cacna1sQ02789 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,16■■■□□ 2,58
Cacna1sQ02789 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC31,15■■■□□ 2,58
Cacna1sQ02789 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC31,15■■■□□ 2,58
Cacna1sQ02789 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC31,14■■■□□ 2,58
Cacna1sQ02789 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31,14■■■□□ 2,58
Cacna1sQ02789 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC31,13■■■□□ 2,57
Cacna1sQ02789 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,12■■■□□ 2,57
Cacna1sQ02789 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31,12■■■□□ 2,57
Cacna1sQ02789 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC31,11■■■□□ 2,57
Cacna1sQ02789 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC31,11■■■□□ 2,57
Cacna1sQ02789 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC31,11■■■□□ 2,57
Cacna1sQ02789 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31,1■■■□□ 2,57
Cacna1sQ02789 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,1■■■□□ 2,57
Cacna1sQ02789 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC31,1■■■□□ 2,57
Cacna1sQ02789 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC31,09■■■□□ 2,57
Cacna1sQ02789 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,09■■■□□ 2,57
Cacna1sQ02789 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC31,08■■■□□ 2,57
Cacna1sQ02789 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,08■■■□□ 2,57
Cacna1sQ02789 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,08■■■□□ 2,57
Cacna1sQ02789 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC31,07■■■□□ 2,56
Cacna1sQ02789 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31,07■■■□□ 2,56
Cacna1sQ02789 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,06■■■□□ 2,56
Cacna1sQ02789 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC31,05■■■□□ 2,56
Cacna1sQ02789 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,04■■■□□ 2,56
Cacna1sQ02789 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,04■■■□□ 2,56
Cacna1sQ02789 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31,04■■■□□ 2,56
Cacna1sQ02789 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC31,04■■■□□ 2,56
Cacna1sQ02789 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC31,04■■■□□ 2,56
Cacna1sQ02789 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC31,04■■■□□ 2,56
Cacna1sQ02789 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,03■■■□□ 2,56
Cacna1sQ02789 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31,02■■■□□ 2,56
Cacna1sQ02789 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC31,02■■■□□ 2,56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12,2 ms