Protein–RNA interactions for Protein: Q02788

Col6a2, Collagen alpha-2(VI) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,034 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col6a2Q02788 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Col6a2Q02788 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Col6a2Q02788 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Col6a2Q02788 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Col6a2Q02788 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Col6a2Q02788 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Col6a2Q02788 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Col6a2Q02788 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Col6a2Q02788 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Col6a2Q02788 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Col6a2Q02788 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Col6a2Q02788 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Col6a2Q02788 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Col6a2Q02788 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Col6a2Q02788 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Col6a2Q02788 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Col6a2Q02788 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Col6a2Q02788 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Col6a2Q02788 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Col6a2Q02788 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Col6a2Q02788 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Col6a2Q02788 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Col6a2Q02788 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Col6a2Q02788 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Col6a2Q02788 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Col6a2Q02788 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Col6a2Q02788 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Col6a2Q02788 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Col6a2Q02788 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Col6a2Q02788 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Col6a2Q02788 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Col6a2Q02788 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Col6a2Q02788 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Col6a2Q02788 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Col6a2Q02788 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Col6a2Q02788 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Col6a2Q02788 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Col6a2Q02788 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Col6a2Q02788 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Col6a2Q02788 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Col6a2Q02788 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Col6a2Q02788 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Col6a2Q02788 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Col6a2Q02788 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Col6a2Q02788 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Col6a2Q02788 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Col6a2Q02788 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Col6a2Q02788 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Col6a2Q02788 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Col6a2Q02788 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Col6a2Q02788 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Col6a2Q02788 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Col6a2Q02788 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Col6a2Q02788 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Col6a2Q02788 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Col6a2Q02788 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Col6a2Q02788 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Col6a2Q02788 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Col6a2Q02788 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Col6a2Q02788 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Col6a2Q02788 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Col6a2Q02788 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Col6a2Q02788 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Col6a2Q02788 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Col6a2Q02788 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Col6a2Q02788 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Col6a2Q02788 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Col6a2Q02788 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Col6a2Q02788 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Col6a2Q02788 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Col6a2Q02788 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Col6a2Q02788 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Col6a2Q02788 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Col6a2Q02788 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Col6a2Q02788 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Col6a2Q02788 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Col6a2Q02788 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Col6a2Q02788 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Col6a2Q02788 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Col6a2Q02788 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Col6a2Q02788 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Col6a2Q02788 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Col6a2Q02788 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Col6a2Q02788 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Col6a2Q02788 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Col6a2Q02788 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Col6a2Q02788 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Col6a2Q02788 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Col6a2Q02788 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Col6a2Q02788 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Col6a2Q02788 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Col6a2Q02788 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Col6a2Q02788 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Col6a2Q02788 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Col6a2Q02788 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Col6a2Q02788 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Col6a2Q02788 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Col6a2Q02788 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Col6a2Q02788 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Col6a2Q02788 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms