Protein–RNA interactions for Protein: Q02591

Gsc, Homeobox protein goosecoid, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GscQ02591 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GscQ02591 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GscQ02591 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GscQ02591 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GscQ02591 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GscQ02591 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
GscQ02591 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
GscQ02591 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
GscQ02591 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
GscQ02591 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
GscQ02591 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GscQ02591 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GscQ02591 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GscQ02591 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GscQ02591 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GscQ02591 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GscQ02591 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GscQ02591 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GscQ02591 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GscQ02591 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GscQ02591 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GscQ02591 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GscQ02591 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GscQ02591 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GscQ02591 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GscQ02591 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GscQ02591 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GscQ02591 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GscQ02591 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GscQ02591 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GscQ02591 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GscQ02591 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GscQ02591 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GscQ02591 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GscQ02591 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GscQ02591 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GscQ02591 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GscQ02591 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GscQ02591 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GscQ02591 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GscQ02591 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GscQ02591 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GscQ02591 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GscQ02591 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GscQ02591 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC25■■□□□ 1.59
GscQ02591 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
GscQ02591 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GscQ02591 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GscQ02591 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GscQ02591 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GscQ02591 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GscQ02591 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GscQ02591 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GscQ02591 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GscQ02591 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GscQ02591 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GscQ02591 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GscQ02591 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GscQ02591 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GscQ02591 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GscQ02591 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GscQ02591 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GscQ02591 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GscQ02591 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GscQ02591 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GscQ02591 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
GscQ02591 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GscQ02591 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GscQ02591 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GscQ02591 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GscQ02591 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GscQ02591 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GscQ02591 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GscQ02591 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GscQ02591 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GscQ02591 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GscQ02591 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GscQ02591 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GscQ02591 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GscQ02591 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GscQ02591 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GscQ02591 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GscQ02591 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
GscQ02591 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
GscQ02591 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
GscQ02591 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GscQ02591 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GscQ02591 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GscQ02591 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GscQ02591 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GscQ02591 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GscQ02591 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GscQ02591 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GscQ02591 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GscQ02591 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GscQ02591 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GscQ02591 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
GscQ02591 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GscQ02591 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GscQ02591 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms