Protein–RNA interactions for Protein: Q02576

Nhlh1, Helix-loop-helix protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlh1Q02576 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Nhlh1Q02576 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nhlh1Q02576 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nhlh1Q02576 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Nhlh1Q02576 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nhlh1Q02576 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nhlh1Q02576 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nhlh1Q02576 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Nhlh1Q02576 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Nhlh1Q02576 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nhlh1Q02576 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Nhlh1Q02576 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Nhlh1Q02576 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Nhlh1Q02576 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Nhlh1Q02576 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Nhlh1Q02576 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Nhlh1Q02576 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nhlh1Q02576 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nhlh1Q02576 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nhlh1Q02576 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Nhlh1Q02576 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nhlh1Q02576 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nhlh1Q02576 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Nhlh1Q02576 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Nhlh1Q02576 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Nhlh1Q02576 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Nhlh1Q02576 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Nhlh1Q02576 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Nhlh1Q02576 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nhlh1Q02576 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nhlh1Q02576 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Nhlh1Q02576 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nhlh1Q02576 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nhlh1Q02576 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nhlh1Q02576 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nhlh1Q02576 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nhlh1Q02576 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nhlh1Q02576 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nhlh1Q02576 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nhlh1Q02576 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nhlh1Q02576 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nhlh1Q02576 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nhlh1Q02576 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nhlh1Q02576 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nhlh1Q02576 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nhlh1Q02576 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nhlh1Q02576 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nhlh1Q02576 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nhlh1Q02576 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Nhlh1Q02576 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Nhlh1Q02576 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Nhlh1Q02576 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nhlh1Q02576 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nhlh1Q02576 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nhlh1Q02576 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nhlh1Q02576 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nhlh1Q02576 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nhlh1Q02576 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Nhlh1Q02576 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nhlh1Q02576 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nhlh1Q02576 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nhlh1Q02576 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nhlh1Q02576 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nhlh1Q02576 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nhlh1Q02576 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nhlh1Q02576 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nhlh1Q02576 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nhlh1Q02576 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nhlh1Q02576 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Nhlh1Q02576 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nhlh1Q02576 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nhlh1Q02576 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nhlh1Q02576 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nhlh1Q02576 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nhlh1Q02576 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nhlh1Q02576 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nhlh1Q02576 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nhlh1Q02576 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nhlh1Q02576 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nhlh1Q02576 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Nhlh1Q02576 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nhlh1Q02576 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Nhlh1Q02576 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nhlh1Q02576 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nhlh1Q02576 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nhlh1Q02576 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nhlh1Q02576 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nhlh1Q02576 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Nhlh1Q02576 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nhlh1Q02576 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Nhlh1Q02576 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nhlh1Q02576 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nhlh1Q02576 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nhlh1Q02576 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Nhlh1Q02576 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Nhlh1Q02576 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Nhlh1Q02576 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Nhlh1Q02576 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nhlh1Q02576 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nhlh1Q02576 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 102 ms