Protein–RNA interactions for Protein: Q01853

Vcp, Transitional endoplasmic reticulum ATPase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VcpQ01853 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
VcpQ01853 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
VcpQ01853 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
VcpQ01853 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
VcpQ01853 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
VcpQ01853 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
VcpQ01853 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
VcpQ01853 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
VcpQ01853 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
VcpQ01853 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
VcpQ01853 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
VcpQ01853 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
VcpQ01853 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
VcpQ01853 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
VcpQ01853 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
VcpQ01853 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
VcpQ01853 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
VcpQ01853 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
VcpQ01853 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
VcpQ01853 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
VcpQ01853 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
VcpQ01853 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
VcpQ01853 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
VcpQ01853 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
VcpQ01853 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
VcpQ01853 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
VcpQ01853 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
VcpQ01853 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
VcpQ01853 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
VcpQ01853 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
VcpQ01853 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
VcpQ01853 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
VcpQ01853 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
VcpQ01853 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
VcpQ01853 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
VcpQ01853 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
VcpQ01853 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
VcpQ01853 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
VcpQ01853 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
VcpQ01853 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
VcpQ01853 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
VcpQ01853 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
VcpQ01853 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
VcpQ01853 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
VcpQ01853 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
VcpQ01853 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
VcpQ01853 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
VcpQ01853 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
VcpQ01853 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
VcpQ01853 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
VcpQ01853 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
VcpQ01853 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
VcpQ01853 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
VcpQ01853 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
VcpQ01853 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
VcpQ01853 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
VcpQ01853 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
VcpQ01853 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
VcpQ01853 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
VcpQ01853 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
VcpQ01853 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
VcpQ01853 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
VcpQ01853 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
VcpQ01853 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
VcpQ01853 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
VcpQ01853 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
VcpQ01853 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
VcpQ01853 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
VcpQ01853 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
VcpQ01853 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
VcpQ01853 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
VcpQ01853 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
VcpQ01853 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
VcpQ01853 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
VcpQ01853 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
VcpQ01853 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
VcpQ01853 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
VcpQ01853 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
VcpQ01853 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
VcpQ01853 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
VcpQ01853 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
VcpQ01853 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
VcpQ01853 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
VcpQ01853 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
VcpQ01853 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
VcpQ01853 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
VcpQ01853 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
VcpQ01853 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
VcpQ01853 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
VcpQ01853 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
VcpQ01853 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
VcpQ01853 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
VcpQ01853 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
VcpQ01853 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
VcpQ01853 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
VcpQ01853 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
VcpQ01853 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
VcpQ01853 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
VcpQ01853 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
VcpQ01853 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms