Protein–RNA interactions for Protein: Q01098

Grin2c, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2C, mousemouse

Predictions only

Length 1,239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2cQ01098 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Grin2cQ01098 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Grin2cQ01098 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Grin2cQ01098 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Grin2cQ01098 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Grin2cQ01098 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Grin2cQ01098 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Grin2cQ01098 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Grin2cQ01098 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Grin2cQ01098 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Grin2cQ01098 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Grin2cQ01098 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Grin2cQ01098 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Grin2cQ01098 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Grin2cQ01098 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Grin2cQ01098 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Grin2cQ01098 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Grin2cQ01098 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Grin2cQ01098 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Grin2cQ01098 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Grin2cQ01098 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Grin2cQ01098 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Grin2cQ01098 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Grin2cQ01098 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Grin2cQ01098 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Grin2cQ01098 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Grin2cQ01098 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Grin2cQ01098 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Grin2cQ01098 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Grin2cQ01098 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Grin2cQ01098 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Grin2cQ01098 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Grin2cQ01098 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Grin2cQ01098 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Grin2cQ01098 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Grin2cQ01098 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Grin2cQ01098 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Grin2cQ01098 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Grin2cQ01098 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Grin2cQ01098 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Grin2cQ01098 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Grin2cQ01098 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Grin2cQ01098 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Grin2cQ01098 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Grin2cQ01098 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Grin2cQ01098 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Grin2cQ01098 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Grin2cQ01098 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Grin2cQ01098 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Grin2cQ01098 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Grin2cQ01098 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Grin2cQ01098 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Grin2cQ01098 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Grin2cQ01098 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Grin2cQ01098 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Grin2cQ01098 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Grin2cQ01098 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Grin2cQ01098 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Grin2cQ01098 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Grin2cQ01098 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Grin2cQ01098 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Grin2cQ01098 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Grin2cQ01098 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Grin2cQ01098 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Grin2cQ01098 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Grin2cQ01098 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Grin2cQ01098 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Grin2cQ01098 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Grin2cQ01098 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Grin2cQ01098 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Grin2cQ01098 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Grin2cQ01098 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Grin2cQ01098 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Grin2cQ01098 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Grin2cQ01098 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Grin2cQ01098 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Grin2cQ01098 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Grin2cQ01098 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Grin2cQ01098 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Grin2cQ01098 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Grin2cQ01098 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Grin2cQ01098 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Grin2cQ01098 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Grin2cQ01098 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Grin2cQ01098 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Grin2cQ01098 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Grin2cQ01098 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Grin2cQ01098 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Grin2cQ01098 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Grin2cQ01098 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Grin2cQ01098 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Grin2cQ01098 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Grin2cQ01098 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Grin2cQ01098 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Grin2cQ01098 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Grin2cQ01098 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Grin2cQ01098 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Grin2cQ01098 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Grin2cQ01098 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Grin2cQ01098 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms