Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT2

Prcd, Progressive rod-cone degeneration protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 53 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrcdQ00LT2 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PrcdQ00LT2 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PrcdQ00LT2 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PrcdQ00LT2 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PrcdQ00LT2 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PrcdQ00LT2 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PrcdQ00LT2 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PrcdQ00LT2 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PrcdQ00LT2 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PrcdQ00LT2 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PrcdQ00LT2 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PrcdQ00LT2 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PrcdQ00LT2 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PrcdQ00LT2 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PrcdQ00LT2 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PrcdQ00LT2 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PrcdQ00LT2 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PrcdQ00LT2 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PrcdQ00LT2 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PrcdQ00LT2 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PrcdQ00LT2 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PrcdQ00LT2 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PrcdQ00LT2 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PrcdQ00LT2 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PrcdQ00LT2 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PrcdQ00LT2 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PrcdQ00LT2 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PrcdQ00LT2 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PrcdQ00LT2 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PrcdQ00LT2 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PrcdQ00LT2 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PrcdQ00LT2 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PrcdQ00LT2 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PrcdQ00LT2 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PrcdQ00LT2 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PrcdQ00LT2 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PrcdQ00LT2 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PrcdQ00LT2 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PrcdQ00LT2 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PrcdQ00LT2 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PrcdQ00LT2 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PrcdQ00LT2 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PrcdQ00LT2 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PrcdQ00LT2 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PrcdQ00LT2 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PrcdQ00LT2 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PrcdQ00LT2 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PrcdQ00LT2 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PrcdQ00LT2 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PrcdQ00LT2 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PrcdQ00LT2 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PrcdQ00LT2 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PrcdQ00LT2 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PrcdQ00LT2 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PrcdQ00LT2 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PrcdQ00LT2 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PrcdQ00LT2 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PrcdQ00LT2 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PrcdQ00LT2 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PrcdQ00LT2 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PrcdQ00LT2 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PrcdQ00LT2 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PrcdQ00LT2 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PrcdQ00LT2 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PrcdQ00LT2 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
PrcdQ00LT2 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PrcdQ00LT2 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PrcdQ00LT2 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PrcdQ00LT2 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PrcdQ00LT2 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PrcdQ00LT2 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PrcdQ00LT2 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PrcdQ00LT2 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PrcdQ00LT2 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PrcdQ00LT2 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PrcdQ00LT2 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PrcdQ00LT2 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PrcdQ00LT2 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PrcdQ00LT2 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PrcdQ00LT2 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PrcdQ00LT2 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PrcdQ00LT2 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PrcdQ00LT2 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PrcdQ00LT2 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PrcdQ00LT2 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PrcdQ00LT2 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PrcdQ00LT2 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PrcdQ00LT2 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PrcdQ00LT2 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PrcdQ00LT2 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PrcdQ00LT2 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PrcdQ00LT2 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PrcdQ00LT2 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PrcdQ00LT2 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PrcdQ00LT2 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PrcdQ00LT2 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PrcdQ00LT2 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PrcdQ00LT2 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PrcdQ00LT2 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PrcdQ00LT2 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms