Protein–RNA interactions for Protein: Q00609

Cd80, T-lymphocyte activation antigen CD80, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd80Q00609 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cd80Q00609 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cd80Q00609 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cd80Q00609 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cd80Q00609 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cd80Q00609 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cd80Q00609 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cd80Q00609 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Cd80Q00609 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cd80Q00609 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cd80Q00609 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cd80Q00609 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cd80Q00609 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cd80Q00609 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Cd80Q00609 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Cd80Q00609 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Cd80Q00609 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Cd80Q00609 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cd80Q00609 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cd80Q00609 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cd80Q00609 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cd80Q00609 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cd80Q00609 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cd80Q00609 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cd80Q00609 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cd80Q00609 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cd80Q00609 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cd80Q00609 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cd80Q00609 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cd80Q00609 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cd80Q00609 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cd80Q00609 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cd80Q00609 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cd80Q00609 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cd80Q00609 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cd80Q00609 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cd80Q00609 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cd80Q00609 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cd80Q00609 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cd80Q00609 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cd80Q00609 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Cd80Q00609 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cd80Q00609 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cd80Q00609 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Cd80Q00609 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Cd80Q00609 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cd80Q00609 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cd80Q00609 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Cd80Q00609 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cd80Q00609 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Cd80Q00609 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cd80Q00609 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cd80Q00609 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cd80Q00609 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cd80Q00609 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cd80Q00609 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cd80Q00609 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cd80Q00609 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cd80Q00609 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cd80Q00609 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cd80Q00609 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Cd80Q00609 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cd80Q00609 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cd80Q00609 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cd80Q00609 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cd80Q00609 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cd80Q00609 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Cd80Q00609 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cd80Q00609 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cd80Q00609 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cd80Q00609 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cd80Q00609 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cd80Q00609 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cd80Q00609 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cd80Q00609 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Cd80Q00609 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Cd80Q00609 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cd80Q00609 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Cd80Q00609 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cd80Q00609 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cd80Q00609 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cd80Q00609 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cd80Q00609 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Cd80Q00609 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cd80Q00609 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cd80Q00609 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cd80Q00609 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cd80Q00609 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cd80Q00609 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cd80Q00609 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cd80Q00609 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cd80Q00609 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Cd80Q00609 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cd80Q00609 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cd80Q00609 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
Cd80Q00609 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Cd80Q00609 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
Cd80Q00609 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
Cd80Q00609 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cd80Q00609 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms