Protein–RNA interactions for Protein: Q00420

Gabpb1, GA-binding protein subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabpb1Q00420 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gabpb1Q00420 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gabpb1Q00420 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gabpb1Q00420 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gabpb1Q00420 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gabpb1Q00420 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gabpb1Q00420 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gabpb1Q00420 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gabpb1Q00420 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gabpb1Q00420 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gabpb1Q00420 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gabpb1Q00420 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gabpb1Q00420 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gabpb1Q00420 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gabpb1Q00420 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gabpb1Q00420 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gabpb1Q00420 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gabpb1Q00420 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gabpb1Q00420 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gabpb1Q00420 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gabpb1Q00420 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gabpb1Q00420 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gabpb1Q00420 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gabpb1Q00420 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gabpb1Q00420 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gabpb1Q00420 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gabpb1Q00420 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gabpb1Q00420 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gabpb1Q00420 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Gabpb1Q00420 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gabpb1Q00420 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Gabpb1Q00420 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
Gabpb1Q00420 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Gabpb1Q00420 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Gabpb1Q00420 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gabpb1Q00420 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gabpb1Q00420 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gabpb1Q00420 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gabpb1Q00420 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gabpb1Q00420 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gabpb1Q00420 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Gabpb1Q00420 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Gabpb1Q00420 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gabpb1Q00420 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gabpb1Q00420 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gabpb1Q00420 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gabpb1Q00420 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gabpb1Q00420 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Gabpb1Q00420 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gabpb1Q00420 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gabpb1Q00420 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gabpb1Q00420 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Gabpb1Q00420 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gabpb1Q00420 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Gabpb1Q00420 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Gabpb1Q00420 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Gabpb1Q00420 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gabpb1Q00420 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gabpb1Q00420 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gabpb1Q00420 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gabpb1Q00420 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gabpb1Q00420 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gabpb1Q00420 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gabpb1Q00420 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gabpb1Q00420 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gabpb1Q00420 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gabpb1Q00420 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gabpb1Q00420 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gabpb1Q00420 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gabpb1Q00420 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gabpb1Q00420 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gabpb1Q00420 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gabpb1Q00420 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gabpb1Q00420 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gabpb1Q00420 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gabpb1Q00420 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gabpb1Q00420 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gabpb1Q00420 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gabpb1Q00420 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gabpb1Q00420 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gabpb1Q00420 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gabpb1Q00420 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gabpb1Q00420 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gabpb1Q00420 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Gabpb1Q00420 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gabpb1Q00420 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gabpb1Q00420 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Gabpb1Q00420 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gabpb1Q00420 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gabpb1Q00420 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gabpb1Q00420 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gabpb1Q00420 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gabpb1Q00420 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gabpb1Q00420 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gabpb1Q00420 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gabpb1Q00420 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gabpb1Q00420 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gabpb1Q00420 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gabpb1Q00420 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gabpb1Q00420 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.7 ms