Protein–RNA interactions for Protein: Q00262

Stx2, Syntaxin-2, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx2Q00262 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Stx2Q00262 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Stx2Q00262 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Stx2Q00262 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Stx2Q00262 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Stx2Q00262 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Stx2Q00262 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Stx2Q00262 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Stx2Q00262 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Stx2Q00262 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Stx2Q00262 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Stx2Q00262 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Stx2Q00262 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Stx2Q00262 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Stx2Q00262 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Stx2Q00262 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Stx2Q00262 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Stx2Q00262 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Stx2Q00262 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Stx2Q00262 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Stx2Q00262 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Stx2Q00262 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Stx2Q00262 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Stx2Q00262 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Stx2Q00262 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Stx2Q00262 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Stx2Q00262 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Stx2Q00262 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Stx2Q00262 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Stx2Q00262 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Stx2Q00262 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Stx2Q00262 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Stx2Q00262 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Stx2Q00262 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Stx2Q00262 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Stx2Q00262 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Stx2Q00262 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Stx2Q00262 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Stx2Q00262 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Stx2Q00262 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Stx2Q00262 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Stx2Q00262 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Stx2Q00262 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Stx2Q00262 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Stx2Q00262 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Stx2Q00262 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Stx2Q00262 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Stx2Q00262 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Stx2Q00262 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Stx2Q00262 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Stx2Q00262 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Stx2Q00262 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Stx2Q00262 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Stx2Q00262 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Stx2Q00262 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Stx2Q00262 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Stx2Q00262 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Stx2Q00262 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Stx2Q00262 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Stx2Q00262 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Stx2Q00262 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Stx2Q00262 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Stx2Q00262 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Stx2Q00262 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Stx2Q00262 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Stx2Q00262 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Stx2Q00262 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Stx2Q00262 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Stx2Q00262 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Stx2Q00262 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Stx2Q00262 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Stx2Q00262 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Stx2Q00262 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Stx2Q00262 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
Stx2Q00262 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Stx2Q00262 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Stx2Q00262 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Stx2Q00262 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Stx2Q00262 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Stx2Q00262 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Stx2Q00262 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Stx2Q00262 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Stx2Q00262 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Stx2Q00262 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Stx2Q00262 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Stx2Q00262 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Stx2Q00262 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Stx2Q00262 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Stx2Q00262 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Stx2Q00262 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Stx2Q00262 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Stx2Q00262 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Stx2Q00262 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Stx2Q00262 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Stx2Q00262 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Stx2Q00262 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Stx2Q00262 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Stx2Q00262 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Stx2Q00262 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Stx2Q00262 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms