Protein–RNA interactions for Protein: P99024

Tubb5, Tubulin beta-5 chain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb5P99024 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tubb5P99024 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Tubb5P99024 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tubb5P99024 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tubb5P99024 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tubb5P99024 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tubb5P99024 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tubb5P99024 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tubb5P99024 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tubb5P99024 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tubb5P99024 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tubb5P99024 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tubb5P99024 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Tubb5P99024 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tubb5P99024 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tubb5P99024 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tubb5P99024 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tubb5P99024 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tubb5P99024 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tubb5P99024 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tubb5P99024 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tubb5P99024 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tubb5P99024 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tubb5P99024 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tubb5P99024 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tubb5P99024 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tubb5P99024 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tubb5P99024 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tubb5P99024 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tubb5P99024 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tubb5P99024 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tubb5P99024 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tubb5P99024 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tubb5P99024 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tubb5P99024 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tubb5P99024 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tubb5P99024 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tubb5P99024 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Tubb5P99024 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Tubb5P99024 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Tubb5P99024 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Tubb5P99024 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Tubb5P99024 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Tubb5P99024 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Tubb5P99024 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tubb5P99024 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tubb5P99024 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tubb5P99024 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tubb5P99024 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tubb5P99024 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tubb5P99024 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tubb5P99024 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tubb5P99024 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tubb5P99024 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tubb5P99024 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tubb5P99024 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tubb5P99024 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tubb5P99024 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tubb5P99024 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tubb5P99024 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tubb5P99024 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Tubb5P99024 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tubb5P99024 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tubb5P99024 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tubb5P99024 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tubb5P99024 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tubb5P99024 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Tubb5P99024 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Tubb5P99024 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Tubb5P99024 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tubb5P99024 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tubb5P99024 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tubb5P99024 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tubb5P99024 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tubb5P99024 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tubb5P99024 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tubb5P99024 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tubb5P99024 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tubb5P99024 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tubb5P99024 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tubb5P99024 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tubb5P99024 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tubb5P99024 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tubb5P99024 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tubb5P99024 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tubb5P99024 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tubb5P99024 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tubb5P99024 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tubb5P99024 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tubb5P99024 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tubb5P99024 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tubb5P99024 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tubb5P99024 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tubb5P99024 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tubb5P99024 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tubb5P99024 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tubb5P99024 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tubb5P99024 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tubb5P99024 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tubb5P99024 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12 ms