Protein–RNA interactions for Protein: P97769

Cited1, Cbp/p300-interacting transactivator 1, mousemouse

Predictions only

Length 203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cited1P97769 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cited1P97769 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cited1P97769 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cited1P97769 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cited1P97769 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cited1P97769 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cited1P97769 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cited1P97769 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cited1P97769 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cited1P97769 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cited1P97769 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cited1P97769 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cited1P97769 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cited1P97769 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cited1P97769 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cited1P97769 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cited1P97769 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cited1P97769 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Cited1P97769 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Cited1P97769 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Cited1P97769 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Cited1P97769 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cited1P97769 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cited1P97769 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cited1P97769 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cited1P97769 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cited1P97769 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Cited1P97769 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cited1P97769 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cited1P97769 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cited1P97769 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Cited1P97769 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cited1P97769 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cited1P97769 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cited1P97769 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cited1P97769 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cited1P97769 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cited1P97769 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cited1P97769 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cited1P97769 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cited1P97769 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cited1P97769 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cited1P97769 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cited1P97769 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cited1P97769 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cited1P97769 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cited1P97769 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cited1P97769 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cited1P97769 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cited1P97769 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cited1P97769 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Cited1P97769 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cited1P97769 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cited1P97769 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cited1P97769 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cited1P97769 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cited1P97769 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cited1P97769 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cited1P97769 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cited1P97769 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cited1P97769 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cited1P97769 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cited1P97769 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cited1P97769 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cited1P97769 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cited1P97769 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cited1P97769 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cited1P97769 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cited1P97769 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cited1P97769 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cited1P97769 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cited1P97769 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cited1P97769 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cited1P97769 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cited1P97769 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cited1P97769 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cited1P97769 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cited1P97769 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cited1P97769 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cited1P97769 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cited1P97769 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cited1P97769 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cited1P97769 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cited1P97769 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cited1P97769 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cited1P97769 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cited1P97769 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cited1P97769 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cited1P97769 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cited1P97769 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cited1P97769 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cited1P97769 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cited1P97769 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cited1P97769 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cited1P97769 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cited1P97769 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cited1P97769 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cited1P97769 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cited1P97769 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cited1P97769 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms