Protein–RNA interactions for Protein: P97471

Smad4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad4P97471 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Smad4P97471 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Smad4P97471 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Smad4P97471 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Smad4P97471 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Smad4P97471 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Smad4P97471 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Smad4P97471 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Smad4P97471 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Smad4P97471 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Smad4P97471 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Smad4P97471 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Smad4P97471 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Smad4P97471 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Smad4P97471 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Smad4P97471 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Smad4P97471 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Smad4P97471 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Smad4P97471 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Smad4P97471 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Smad4P97471 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Smad4P97471 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Smad4P97471 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Smad4P97471 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Smad4P97471 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Smad4P97471 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Smad4P97471 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Smad4P97471 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Smad4P97471 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Smad4P97471 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Smad4P97471 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Smad4P97471 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Smad4P97471 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Smad4P97471 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Smad4P97471 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Smad4P97471 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Smad4P97471 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Smad4P97471 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Smad4P97471 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Smad4P97471 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Smad4P97471 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Smad4P97471 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Smad4P97471 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Smad4P97471 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Smad4P97471 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Smad4P97471 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Smad4P97471 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Smad4P97471 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Smad4P97471 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Smad4P97471 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Smad4P97471 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Smad4P97471 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Smad4P97471 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Smad4P97471 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Smad4P97471 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Smad4P97471 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Smad4P97471 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Smad4P97471 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Smad4P97471 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Smad4P97471 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Smad4P97471 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Smad4P97471 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Smad4P97471 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Smad4P97471 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Smad4P97471 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Smad4P97471 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Smad4P97471 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Smad4P97471 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Smad4P97471 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Smad4P97471 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Smad4P97471 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Smad4P97471 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Smad4P97471 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Smad4P97471 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Smad4P97471 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Smad4P97471 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Smad4P97471 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Smad4P97471 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Smad4P97471 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Smad4P97471 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Smad4P97471 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Smad4P97471 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Smad4P97471 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Smad4P97471 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Smad4P97471 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Smad4P97471 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Smad4P97471 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Smad4P97471 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Smad4P97471 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Smad4P97471 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Smad4P97471 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Smad4P97471 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Smad4P97471 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Smad4P97471 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Smad4P97471 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Smad4P97471 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Smad4P97471 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Smad4P97471 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Smad4P97471 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Smad4P97471 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms