Protein–RNA interactions for Protein: P97454

Smad5, Mothers against decapentaplegic homolog 5, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad5P97454 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Smad5P97454 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Smad5P97454 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Smad5P97454 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Smad5P97454 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Smad5P97454 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Smad5P97454 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Smad5P97454 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Smad5P97454 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Smad5P97454 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Smad5P97454 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Smad5P97454 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Smad5P97454 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Smad5P97454 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Smad5P97454 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Smad5P97454 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Smad5P97454 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Smad5P97454 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Smad5P97454 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Smad5P97454 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Smad5P97454 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Smad5P97454 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Smad5P97454 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Smad5P97454 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Smad5P97454 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Smad5P97454 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Smad5P97454 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Smad5P97454 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Smad5P97454 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Smad5P97454 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Smad5P97454 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Smad5P97454 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Smad5P97454 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Smad5P97454 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Smad5P97454 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Smad5P97454 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Smad5P97454 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Smad5P97454 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Smad5P97454 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Smad5P97454 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Smad5P97454 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Smad5P97454 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Smad5P97454 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Smad5P97454 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Smad5P97454 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Smad5P97454 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Smad5P97454 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Smad5P97454 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Smad5P97454 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Smad5P97454 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Smad5P97454 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Smad5P97454 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Smad5P97454 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Smad5P97454 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Smad5P97454 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Smad5P97454 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Smad5P97454 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Smad5P97454 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Smad5P97454 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Smad5P97454 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Smad5P97454 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Smad5P97454 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Smad5P97454 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Smad5P97454 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Smad5P97454 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Smad5P97454 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Smad5P97454 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Smad5P97454 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Smad5P97454 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Smad5P97454 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Smad5P97454 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Smad5P97454 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Smad5P97454 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Smad5P97454 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Smad5P97454 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Smad5P97454 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Smad5P97454 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Smad5P97454 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Smad5P97454 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Smad5P97454 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Smad5P97454 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Smad5P97454 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Smad5P97454 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Smad5P97454 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Smad5P97454 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Smad5P97454 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Smad5P97454 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Smad5P97454 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Smad5P97454 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Smad5P97454 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Smad5P97454 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Smad5P97454 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Smad5P97454 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Smad5P97454 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Smad5P97454 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Smad5P97454 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Smad5P97454 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Smad5P97454 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Smad5P97454 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Smad5P97454 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms