Protein–RNA interactions for Protein: P97427

Crmp1, Dihydropyrimidinase-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 572 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crmp1P97427 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Crmp1P97427 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Crmp1P97427 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Crmp1P97427 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Crmp1P97427 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Crmp1P97427 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Crmp1P97427 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Crmp1P97427 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Crmp1P97427 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Crmp1P97427 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Crmp1P97427 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Crmp1P97427 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Crmp1P97427 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Crmp1P97427 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Crmp1P97427 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Crmp1P97427 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Crmp1P97427 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Crmp1P97427 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Crmp1P97427 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Crmp1P97427 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Crmp1P97427 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Crmp1P97427 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Crmp1P97427 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Crmp1P97427 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Crmp1P97427 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Crmp1P97427 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Crmp1P97427 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Crmp1P97427 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Crmp1P97427 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Crmp1P97427 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Crmp1P97427 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Crmp1P97427 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Crmp1P97427 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Crmp1P97427 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Crmp1P97427 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Crmp1P97427 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Crmp1P97427 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Crmp1P97427 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Crmp1P97427 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Crmp1P97427 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Crmp1P97427 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Crmp1P97427 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Crmp1P97427 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Crmp1P97427 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Crmp1P97427 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Crmp1P97427 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Crmp1P97427 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Crmp1P97427 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Crmp1P97427 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Crmp1P97427 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Crmp1P97427 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Crmp1P97427 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Crmp1P97427 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Crmp1P97427 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Crmp1P97427 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Crmp1P97427 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Crmp1P97427 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Crmp1P97427 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Crmp1P97427 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Crmp1P97427 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Crmp1P97427 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Crmp1P97427 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Crmp1P97427 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Crmp1P97427 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Crmp1P97427 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Crmp1P97427 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Crmp1P97427 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Crmp1P97427 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Crmp1P97427 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Crmp1P97427 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Crmp1P97427 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Crmp1P97427 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Crmp1P97427 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Crmp1P97427 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Crmp1P97427 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Crmp1P97427 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Crmp1P97427 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Crmp1P97427 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Crmp1P97427 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Crmp1P97427 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Crmp1P97427 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Crmp1P97427 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Crmp1P97427 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Crmp1P97427 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Crmp1P97427 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Crmp1P97427 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Crmp1P97427 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Crmp1P97427 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Crmp1P97427 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Crmp1P97427 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Crmp1P97427 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Crmp1P97427 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Crmp1P97427 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Crmp1P97427 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Crmp1P97427 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Crmp1P97427 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Crmp1P97427 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Crmp1P97427 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Crmp1P97427 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Crmp1P97427 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 177.4 ms