Protein–RNA interactions for Protein: P97376

Frg1, Protein FRG1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 258 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frg1P97376 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Frg1P97376 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Frg1P97376 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Frg1P97376 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Frg1P97376 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Frg1P97376 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Frg1P97376 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Frg1P97376 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Frg1P97376 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Frg1P97376 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Frg1P97376 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Frg1P97376 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Frg1P97376 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Frg1P97376 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Frg1P97376 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Frg1P97376 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Frg1P97376 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Frg1P97376 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Frg1P97376 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Frg1P97376 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Frg1P97376 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Frg1P97376 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Frg1P97376 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Frg1P97376 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Frg1P97376 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Frg1P97376 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Frg1P97376 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Frg1P97376 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Frg1P97376 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Frg1P97376 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Frg1P97376 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Frg1P97376 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Frg1P97376 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Frg1P97376 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Frg1P97376 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Frg1P97376 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Frg1P97376 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Frg1P97376 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Frg1P97376 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Frg1P97376 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Frg1P97376 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Frg1P97376 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Frg1P97376 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Frg1P97376 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Frg1P97376 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Frg1P97376 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Frg1P97376 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Frg1P97376 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Frg1P97376 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Frg1P97376 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Frg1P97376 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Frg1P97376 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Frg1P97376 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Frg1P97376 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Frg1P97376 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Frg1P97376 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Frg1P97376 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Frg1P97376 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Frg1P97376 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Frg1P97376 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Frg1P97376 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Frg1P97376 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Frg1P97376 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Frg1P97376 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Frg1P97376 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Frg1P97376 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Frg1P97376 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Frg1P97376 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Frg1P97376 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Frg1P97376 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Frg1P97376 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Frg1P97376 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Frg1P97376 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Frg1P97376 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Frg1P97376 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Frg1P97376 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Frg1P97376 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Frg1P97376 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Frg1P97376 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Frg1P97376 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Frg1P97376 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Frg1P97376 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Frg1P97376 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Frg1P97376 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Frg1P97376 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Frg1P97376 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Frg1P97376 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Frg1P97376 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Frg1P97376 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Frg1P97376 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Frg1P97376 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Frg1P97376 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Frg1P97376 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Frg1P97376 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Frg1P97376 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Frg1P97376 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Frg1P97376 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Frg1P97376 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Frg1P97376 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Frg1P97376 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.6 ms