Protein–RNA interactions for Protein: P82347

Sgcd, Delta-sarcoglycan, mousemouse

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Length 289 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgcdP82347 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SgcdP82347 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SgcdP82347 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SgcdP82347 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SgcdP82347 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SgcdP82347 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SgcdP82347 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SgcdP82347 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SgcdP82347 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SgcdP82347 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SgcdP82347 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SgcdP82347 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SgcdP82347 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SgcdP82347 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SgcdP82347 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SgcdP82347 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SgcdP82347 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SgcdP82347 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SgcdP82347 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
SgcdP82347 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SgcdP82347 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SgcdP82347 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SgcdP82347 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SgcdP82347 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SgcdP82347 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SgcdP82347 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SgcdP82347 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SgcdP82347 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SgcdP82347 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SgcdP82347 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SgcdP82347 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SgcdP82347 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SgcdP82347 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SgcdP82347 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SgcdP82347 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SgcdP82347 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SgcdP82347 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SgcdP82347 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SgcdP82347 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SgcdP82347 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SgcdP82347 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SgcdP82347 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SgcdP82347 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SgcdP82347 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SgcdP82347 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SgcdP82347 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SgcdP82347 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SgcdP82347 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SgcdP82347 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SgcdP82347 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SgcdP82347 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SgcdP82347 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SgcdP82347 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SgcdP82347 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SgcdP82347 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SgcdP82347 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SgcdP82347 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SgcdP82347 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SgcdP82347 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SgcdP82347 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SgcdP82347 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SgcdP82347 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SgcdP82347 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SgcdP82347 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SgcdP82347 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SgcdP82347 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SgcdP82347 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SgcdP82347 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SgcdP82347 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SgcdP82347 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SgcdP82347 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SgcdP82347 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SgcdP82347 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SgcdP82347 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SgcdP82347 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SgcdP82347 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SgcdP82347 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SgcdP82347 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SgcdP82347 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SgcdP82347 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SgcdP82347 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SgcdP82347 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SgcdP82347 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SgcdP82347 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SgcdP82347 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SgcdP82347 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
SgcdP82347 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SgcdP82347 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SgcdP82347 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SgcdP82347 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
SgcdP82347 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SgcdP82347 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SgcdP82347 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
SgcdP82347 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SgcdP82347 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SgcdP82347 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SgcdP82347 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SgcdP82347 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SgcdP82347 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SgcdP82347 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
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