Protein–RNA interactions for Protein: P81067

Irx3, Iroquois-class homeodomain protein IRX-3, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx3P81067 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
Irx3P81067 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Irx3P81067 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Irx3P81067 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Irx3P81067 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Irx3P81067 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Irx3P81067 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Irx3P81067 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Irx3P81067 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Irx3P81067 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Irx3P81067 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Irx3P81067 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Irx3P81067 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Irx3P81067 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Irx3P81067 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Irx3P81067 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Irx3P81067 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Irx3P81067 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Irx3P81067 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Irx3P81067 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
Irx3P81067 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Irx3P81067 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Irx3P81067 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Irx3P81067 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
Irx3P81067 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Irx3P81067 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Irx3P81067 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Irx3P81067 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Irx3P81067 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Irx3P81067 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Irx3P81067 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Irx3P81067 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
Irx3P81067 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Irx3P81067 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Irx3P81067 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Irx3P81067 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Irx3P81067 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Irx3P81067 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Irx3P81067 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Irx3P81067 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Irx3P81067 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Irx3P81067 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Irx3P81067 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Irx3P81067 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Irx3P81067 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Irx3P81067 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Irx3P81067 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Irx3P81067 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Irx3P81067 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Irx3P81067 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Irx3P81067 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Irx3P81067 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Irx3P81067 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Irx3P81067 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Irx3P81067 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Irx3P81067 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Irx3P81067 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Irx3P81067 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Irx3P81067 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Irx3P81067 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Irx3P81067 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Irx3P81067 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Irx3P81067 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Irx3P81067 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Irx3P81067 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Irx3P81067 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Irx3P81067 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Irx3P81067 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Irx3P81067 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Irx3P81067 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Irx3P81067 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Irx3P81067 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Irx3P81067 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Irx3P81067 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Irx3P81067 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Irx3P81067 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Irx3P81067 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Irx3P81067 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Irx3P81067 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Irx3P81067 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Irx3P81067 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Irx3P81067 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Irx3P81067 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Irx3P81067 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Irx3P81067 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Irx3P81067 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Irx3P81067 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Irx3P81067 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Irx3P81067 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Irx3P81067 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Irx3P81067 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Irx3P81067 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Irx3P81067 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Irx3P81067 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Irx3P81067 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Irx3P81067 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Irx3P81067 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Irx3P81067 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Irx3P81067 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Irx3P81067 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.1 ms