Protein–RNA interactions for Protein: P70698

Ctps1, CTP synthase 1, mousemouse

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctps1P70698 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ctps1P70698 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ctps1P70698 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ctps1P70698 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ctps1P70698 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ctps1P70698 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Ctps1P70698 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ctps1P70698 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ctps1P70698 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ctps1P70698 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ctps1P70698 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ctps1P70698 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ctps1P70698 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ctps1P70698 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ctps1P70698 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ctps1P70698 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ctps1P70698 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ctps1P70698 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ctps1P70698 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ctps1P70698 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ctps1P70698 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ctps1P70698 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ctps1P70698 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ctps1P70698 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ctps1P70698 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ctps1P70698 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ctps1P70698 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ctps1P70698 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Ctps1P70698 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ctps1P70698 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ctps1P70698 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ctps1P70698 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ctps1P70698 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ctps1P70698 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Ctps1P70698 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Ctps1P70698 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ctps1P70698 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ctps1P70698 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ctps1P70698 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ctps1P70698 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ctps1P70698 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ctps1P70698 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ctps1P70698 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ctps1P70698 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ctps1P70698 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ctps1P70698 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ctps1P70698 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ctps1P70698 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ctps1P70698 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ctps1P70698 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Ctps1P70698 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Ctps1P70698 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ctps1P70698 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ctps1P70698 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ctps1P70698 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ctps1P70698 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ctps1P70698 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ctps1P70698 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ctps1P70698 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ctps1P70698 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Ctps1P70698 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ctps1P70698 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ctps1P70698 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ctps1P70698 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ctps1P70698 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ctps1P70698 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ctps1P70698 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ctps1P70698 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ctps1P70698 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ctps1P70698 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ctps1P70698 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Ctps1P70698 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ctps1P70698 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ctps1P70698 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ctps1P70698 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ctps1P70698 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ctps1P70698 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Ctps1P70698 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Ctps1P70698 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ctps1P70698 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ctps1P70698 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ctps1P70698 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ctps1P70698 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ctps1P70698 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ctps1P70698 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ctps1P70698 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ctps1P70698 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ctps1P70698 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ctps1P70698 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ctps1P70698 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ctps1P70698 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ctps1P70698 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ctps1P70698 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ctps1P70698 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ctps1P70698 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ctps1P70698 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Ctps1P70698 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ctps1P70698 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ctps1P70698 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ctps1P70698 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.6 ms