Protein–RNA interactions for Protein: P70452

Stx4, Syntaxin-4, mousemouse

Predictions only

Length 298 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx4P70452 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Stx4P70452 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Stx4P70452 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Stx4P70452 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Stx4P70452 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Stx4P70452 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Stx4P70452 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Stx4P70452 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Stx4P70452 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Stx4P70452 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Stx4P70452 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Stx4P70452 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Stx4P70452 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Stx4P70452 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Stx4P70452 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Stx4P70452 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Stx4P70452 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Stx4P70452 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Stx4P70452 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Stx4P70452 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Stx4P70452 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Stx4P70452 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Stx4P70452 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Stx4P70452 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Stx4P70452 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Stx4P70452 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Stx4P70452 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Stx4P70452 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Stx4P70452 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Stx4P70452 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Stx4P70452 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Stx4P70452 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Stx4P70452 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Stx4P70452 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Stx4P70452 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Stx4P70452 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Stx4P70452 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Stx4P70452 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Stx4P70452 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Stx4P70452 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Stx4P70452 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Stx4P70452 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Stx4P70452 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Stx4P70452 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Stx4P70452 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Stx4P70452 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Stx4P70452 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Stx4P70452 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Stx4P70452 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Stx4P70452 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Stx4P70452 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Stx4P70452 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Stx4P70452 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Stx4P70452 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Stx4P70452 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Stx4P70452 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Stx4P70452 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Stx4P70452 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Stx4P70452 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Stx4P70452 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Stx4P70452 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Stx4P70452 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Stx4P70452 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Stx4P70452 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Stx4P70452 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Stx4P70452 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Stx4P70452 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Stx4P70452 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Stx4P70452 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Stx4P70452 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Stx4P70452 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Stx4P70452 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Stx4P70452 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Stx4P70452 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Stx4P70452 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Stx4P70452 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Stx4P70452 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Stx4P70452 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Stx4P70452 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Stx4P70452 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Stx4P70452 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Stx4P70452 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Stx4P70452 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Stx4P70452 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Stx4P70452 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Stx4P70452 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Stx4P70452 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Stx4P70452 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Stx4P70452 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Stx4P70452 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Stx4P70452 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Stx4P70452 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Stx4P70452 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Stx4P70452 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Stx4P70452 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Stx4P70452 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Stx4P70452 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Stx4P70452 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Stx4P70452 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Stx4P70452 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 264.5 ms