Protein–RNA interactions for Protein: P70248

Myo1f, Unconventional myosin-If, mousemouse

Predictions only

Length 1,099 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myo1fP70248 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Myo1fP70248 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Myo1fP70248 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Myo1fP70248 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Myo1fP70248 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Myo1fP70248 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Myo1fP70248 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Myo1fP70248 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Myo1fP70248 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Myo1fP70248 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Myo1fP70248 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Myo1fP70248 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Myo1fP70248 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Myo1fP70248 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Myo1fP70248 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Myo1fP70248 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Myo1fP70248 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Myo1fP70248 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Myo1fP70248 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Myo1fP70248 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Myo1fP70248 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Myo1fP70248 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Myo1fP70248 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Myo1fP70248 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Myo1fP70248 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Myo1fP70248 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Myo1fP70248 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Myo1fP70248 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Myo1fP70248 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Myo1fP70248 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Myo1fP70248 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Myo1fP70248 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Myo1fP70248 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Myo1fP70248 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Myo1fP70248 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Myo1fP70248 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Myo1fP70248 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Myo1fP70248 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Myo1fP70248 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Myo1fP70248 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Myo1fP70248 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Myo1fP70248 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Myo1fP70248 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Myo1fP70248 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Myo1fP70248 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Myo1fP70248 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Myo1fP70248 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Myo1fP70248 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Myo1fP70248 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Myo1fP70248 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Myo1fP70248 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Myo1fP70248 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Myo1fP70248 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Myo1fP70248 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Myo1fP70248 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Myo1fP70248 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Myo1fP70248 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Myo1fP70248 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Myo1fP70248 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Myo1fP70248 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Myo1fP70248 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Myo1fP70248 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Myo1fP70248 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Myo1fP70248 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Myo1fP70248 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Myo1fP70248 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Myo1fP70248 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Myo1fP70248 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Myo1fP70248 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Myo1fP70248 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Myo1fP70248 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Myo1fP70248 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Myo1fP70248 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Myo1fP70248 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Myo1fP70248 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Myo1fP70248 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Myo1fP70248 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Myo1fP70248 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Myo1fP70248 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Myo1fP70248 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Myo1fP70248 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Myo1fP70248 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Myo1fP70248 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Myo1fP70248 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Myo1fP70248 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Myo1fP70248 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Myo1fP70248 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Myo1fP70248 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Myo1fP70248 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Myo1fP70248 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Myo1fP70248 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Myo1fP70248 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Myo1fP70248 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Myo1fP70248 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Myo1fP70248 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Myo1fP70248 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Myo1fP70248 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Myo1fP70248 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Myo1fP70248 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Myo1fP70248 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms