Protein–RNA interactions for Protein: P63024

Vamp3, Vesicle-associated membrane protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp3P63024 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vamp3P63024 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vamp3P63024 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vamp3P63024 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vamp3P63024 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vamp3P63024 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vamp3P63024 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vamp3P63024 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vamp3P63024 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vamp3P63024 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vamp3P63024 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vamp3P63024 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vamp3P63024 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vamp3P63024 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vamp3P63024 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vamp3P63024 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vamp3P63024 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vamp3P63024 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vamp3P63024 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vamp3P63024 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vamp3P63024 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vamp3P63024 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vamp3P63024 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vamp3P63024 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vamp3P63024 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vamp3P63024 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vamp3P63024 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vamp3P63024 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vamp3P63024 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vamp3P63024 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vamp3P63024 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vamp3P63024 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vamp3P63024 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vamp3P63024 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vamp3P63024 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vamp3P63024 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vamp3P63024 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vamp3P63024 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vamp3P63024 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vamp3P63024 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Vamp3P63024 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vamp3P63024 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Vamp3P63024 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vamp3P63024 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vamp3P63024 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vamp3P63024 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vamp3P63024 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vamp3P63024 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vamp3P63024 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vamp3P63024 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vamp3P63024 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vamp3P63024 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vamp3P63024 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vamp3P63024 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vamp3P63024 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vamp3P63024 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vamp3P63024 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vamp3P63024 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vamp3P63024 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vamp3P63024 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vamp3P63024 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vamp3P63024 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vamp3P63024 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vamp3P63024 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Vamp3P63024 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vamp3P63024 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vamp3P63024 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vamp3P63024 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vamp3P63024 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Vamp3P63024 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Vamp3P63024 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Vamp3P63024 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vamp3P63024 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vamp3P63024 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vamp3P63024 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vamp3P63024 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vamp3P63024 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vamp3P63024 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vamp3P63024 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vamp3P63024 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vamp3P63024 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vamp3P63024 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vamp3P63024 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vamp3P63024 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vamp3P63024 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vamp3P63024 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vamp3P63024 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vamp3P63024 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vamp3P63024 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vamp3P63024 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vamp3P63024 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vamp3P63024 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vamp3P63024 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vamp3P63024 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vamp3P63024 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vamp3P63024 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vamp3P63024 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vamp3P63024 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vamp3P63024 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vamp3P63024 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.1 ms