Protein–RNA interactions for Protein: P62274

Rps29, 40S ribosomal protein S29, mousemouse

Predictions only

Length 56 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps29P62274 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rps29P62274 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rps29P62274 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rps29P62274 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rps29P62274 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rps29P62274 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rps29P62274 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rps29P62274 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rps29P62274 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Rps29P62274 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rps29P62274 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rps29P62274 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rps29P62274 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Rps29P62274 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Rps29P62274 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Rps29P62274 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rps29P62274 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rps29P62274 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rps29P62274 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rps29P62274 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rps29P62274 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Rps29P62274 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rps29P62274 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rps29P62274 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rps29P62274 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rps29P62274 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rps29P62274 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rps29P62274 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rps29P62274 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rps29P62274 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rps29P62274 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rps29P62274 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rps29P62274 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rps29P62274 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rps29P62274 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rps29P62274 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rps29P62274 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rps29P62274 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rps29P62274 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rps29P62274 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Rps29P62274 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rps29P62274 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rps29P62274 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Rps29P62274 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rps29P62274 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rps29P62274 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rps29P62274 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rps29P62274 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rps29P62274 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rps29P62274 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rps29P62274 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rps29P62274 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rps29P62274 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rps29P62274 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rps29P62274 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rps29P62274 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rps29P62274 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rps29P62274 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rps29P62274 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Rps29P62274 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rps29P62274 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rps29P62274 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rps29P62274 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rps29P62274 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rps29P62274 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Rps29P62274 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rps29P62274 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rps29P62274 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rps29P62274 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Rps29P62274 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Rps29P62274 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Rps29P62274 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Rps29P62274 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rps29P62274 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rps29P62274 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rps29P62274 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rps29P62274 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rps29P62274 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rps29P62274 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rps29P62274 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rps29P62274 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rps29P62274 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rps29P62274 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rps29P62274 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rps29P62274 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rps29P62274 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rps29P62274 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rps29P62274 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rps29P62274 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Rps29P62274 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rps29P62274 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rps29P62274 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rps29P62274 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rps29P62274 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rps29P62274 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rps29P62274 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rps29P62274 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rps29P62274 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rps29P62274 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rps29P62274 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7.9 ms