Protein–RNA interactions for Protein: P62192

Psmc1, 26S proteasome regulatory subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmc1P62192 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC25,17■■□□□ 1,62
Psmc1P62192 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,17■■□□□ 1,62
Psmc1P62192 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,16■■□□□ 1,62
Psmc1P62192 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,15■■□□□ 1,62
Psmc1P62192 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,14■■□□□ 1,62
Psmc1P62192 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25,14■■□□□ 1,62
Psmc1P62192 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,14■■□□□ 1,62
Psmc1P62192 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,13■■□□□ 1,61
Psmc1P62192 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,13■■□□□ 1,61
Psmc1P62192 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC25,12■■□□□ 1,61
Psmc1P62192 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC25,12■■□□□ 1,61
Psmc1P62192 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC25,12■■□□□ 1,61
Psmc1P62192 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25,11■■□□□ 1,61
Psmc1P62192 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,11■■□□□ 1,61
Psmc1P62192 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,1■■□□□ 1,61
Psmc1P62192 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25,1■■□□□ 1,61
Psmc1P62192 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,1■■□□□ 1,61
Psmc1P62192 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25,1■■□□□ 1,61
Psmc1P62192 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,08■■□□□ 1,61
Psmc1P62192 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,08■■□□□ 1,61
Psmc1P62192 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25,07■■□□□ 1,6
Psmc1P62192 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC25,07■■□□□ 1,6
Psmc1P62192 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,07■■□□□ 1,6
Psmc1P62192 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC25,07■■□□□ 1,6
Psmc1P62192 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,06■■□□□ 1,6
Psmc1P62192 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25,06■■□□□ 1,6
Psmc1P62192 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC25,06■■□□□ 1,6
Psmc1P62192 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC25,05■■□□□ 1,6
Psmc1P62192 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25,05■■□□□ 1,6
Psmc1P62192 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC25,04■■□□□ 1,6
Psmc1P62192 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC25,04■■□□□ 1,6
Psmc1P62192 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,03■■□□□ 1,6
Psmc1P62192 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25,03■■□□□ 1,6
Psmc1P62192 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,03■■□□□ 1,6
Psmc1P62192 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25,02■■□□□ 1,6
Psmc1P62192 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,02■■□□□ 1,6
Psmc1P62192 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25,02■■□□□ 1,6
Psmc1P62192 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25,02■■□□□ 1,6
Psmc1P62192 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25,01■■□□□ 1,59
Psmc1P62192 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1,59
Psmc1P62192 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC25■■□□□ 1,59
Psmc1P62192 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1,59
Psmc1P62192 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24,98■■□□□ 1,59
Psmc1P62192 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24,98■■□□□ 1,59
Psmc1P62192 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,98■■□□□ 1,59
Psmc1P62192 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24,97■■□□□ 1,59
Psmc1P62192 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24,96■■□□□ 1,59
Psmc1P62192 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,96■■□□□ 1,59
Psmc1P62192 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24,96■■□□□ 1,59
Psmc1P62192 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24,96■■□□□ 1,59
Psmc1P62192 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24,96■■□□□ 1,59
Psmc1P62192 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24,95■■□□□ 1,58
Psmc1P62192 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,95■■□□□ 1,58
Psmc1P62192 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24,93■■□□□ 1,58
Psmc1P62192 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24,93■■□□□ 1,58
Psmc1P62192 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24,92■■□□□ 1,58
Psmc1P62192 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24,91■■□□□ 1,58
Psmc1P62192 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,89■■□□□ 1,58
Psmc1P62192 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,89■■□□□ 1,58
Psmc1P62192 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,89■■□□□ 1,58
Psmc1P62192 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24,89■■□□□ 1,57
Psmc1P62192 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,88■■□□□ 1,57
Psmc1P62192 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,87■■□□□ 1,57
Psmc1P62192 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24,87■■□□□ 1,57
Psmc1P62192 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24,87■■□□□ 1,57
Psmc1P62192 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24,87■■□□□ 1,57
Psmc1P62192 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24,86■■□□□ 1,57
Psmc1P62192 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24,86■■□□□ 1,57
Psmc1P62192 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24,86■■□□□ 1,57
Psmc1P62192 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24,85■■□□□ 1,57
Psmc1P62192 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24,85■■□□□ 1,57
Psmc1P62192 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,85■■□□□ 1,57
Psmc1P62192 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,84■■□□□ 1,57
Psmc1P62192 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24,84■■□□□ 1,57
Psmc1P62192 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,84■■□□□ 1,57
Psmc1P62192 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24,84■■□□□ 1,57
Psmc1P62192 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24,83■■□□□ 1,57
Psmc1P62192 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,83■■□□□ 1,57
Psmc1P62192 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC24,83■■□□□ 1,57
Psmc1P62192 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,83■■□□□ 1,57
Psmc1P62192 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24,83■■□□□ 1,57
Psmc1P62192 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,83■■□□□ 1,57
Psmc1P62192 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24,83■■□□□ 1,56
Psmc1P62192 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,83■■□□□ 1,56
Psmc1P62192 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,82■■□□□ 1,56
Psmc1P62192 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24,82■■□□□ 1,56
Psmc1P62192 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,81■■□□□ 1,56
Psmc1P62192 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,81■■□□□ 1,56
Psmc1P62192 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,8■■□□□ 1,56
Psmc1P62192 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,79■■□□□ 1,56
Psmc1P62192 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,79■■□□□ 1,56
Psmc1P62192 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24,79■■□□□ 1,56
Psmc1P62192 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24,79■■□□□ 1,56
Psmc1P62192 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,79■■□□□ 1,56
Psmc1P62192 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,78■■□□□ 1,56
Psmc1P62192 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,78■■□□□ 1,56
Psmc1P62192 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,77■■□□□ 1,56
Psmc1P62192 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,76■■□□□ 1,55
Psmc1P62192 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC24,76■■□□□ 1,55
Psmc1P62192 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24,76■■□□□ 1,55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31,3 ms