Protein–RNA interactions for Protein: P61967

Ap1s1, AP-1 complex subunit sigma-1A, mousemouse

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap1s1P61967 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ap1s1P61967 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ap1s1P61967 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Ap1s1P61967 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ap1s1P61967 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ap1s1P61967 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ap1s1P61967 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ap1s1P61967 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ap1s1P61967 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ap1s1P61967 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ap1s1P61967 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ap1s1P61967 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ap1s1P61967 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ap1s1P61967 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ap1s1P61967 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Ap1s1P61967 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ap1s1P61967 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ap1s1P61967 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ap1s1P61967 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ap1s1P61967 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ap1s1P61967 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ap1s1P61967 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ap1s1P61967 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Ap1s1P61967 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ap1s1P61967 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ap1s1P61967 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ap1s1P61967 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ap1s1P61967 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ap1s1P61967 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ap1s1P61967 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ap1s1P61967 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ap1s1P61967 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ap1s1P61967 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ap1s1P61967 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ap1s1P61967 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ap1s1P61967 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ap1s1P61967 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ap1s1P61967 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ap1s1P61967 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ap1s1P61967 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ap1s1P61967 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ap1s1P61967 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ap1s1P61967 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ap1s1P61967 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ap1s1P61967 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ap1s1P61967 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ap1s1P61967 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Ap1s1P61967 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Ap1s1P61967 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ap1s1P61967 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ap1s1P61967 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ap1s1P61967 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ap1s1P61967 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Ap1s1P61967 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ap1s1P61967 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ap1s1P61967 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ap1s1P61967 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ap1s1P61967 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ap1s1P61967 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ap1s1P61967 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ap1s1P61967 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ap1s1P61967 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ap1s1P61967 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ap1s1P61967 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ap1s1P61967 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ap1s1P61967 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ap1s1P61967 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ap1s1P61967 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ap1s1P61967 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ap1s1P61967 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Ap1s1P61967 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Ap1s1P61967 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ap1s1P61967 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ap1s1P61967 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ap1s1P61967 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ap1s1P61967 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ap1s1P61967 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ap1s1P61967 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ap1s1P61967 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ap1s1P61967 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ap1s1P61967 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ap1s1P61967 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ap1s1P61967 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ap1s1P61967 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Ap1s1P61967 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ap1s1P61967 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ap1s1P61967 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ap1s1P61967 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Ap1s1P61967 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ap1s1P61967 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ap1s1P61967 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ap1s1P61967 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ap1s1P61967 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ap1s1P61967 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ap1s1P61967 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ap1s1P61967 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ap1s1P61967 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ap1s1P61967 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ap1s1P61967 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ap1s1P61967 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64 ms