Protein–RNA interactions for Protein: P61460

Depdc5, GATOR complex protein DEPDC5, mousemouse

Predictions only

Length 1,591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Depdc5P61460 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
Depdc5P61460 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC36.69■■■■□ 3.46
Depdc5P61460 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
Depdc5P61460 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
Depdc5P61460 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC36.66■■■■□ 3.46
Depdc5P61460 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
Depdc5P61460 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
Depdc5P61460 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
Depdc5P61460 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
Depdc5P61460 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
Depdc5P61460 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC36.63■■■■□ 3.45
Depdc5P61460 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
Depdc5P61460 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC36.62■■■■□ 3.45
Depdc5P61460 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC36.62■■■■□ 3.45
Depdc5P61460 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
Depdc5P61460 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.62■■■■□ 3.45
Depdc5P61460 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC36.62■■■■□ 3.45
Depdc5P61460 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
Depdc5P61460 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
Depdc5P61460 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.6■■■■□ 3.45
Depdc5P61460 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC36.6■■■■□ 3.45
Depdc5P61460 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
Depdc5P61460 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
Depdc5P61460 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC36.57■■■■□ 3.44
Depdc5P61460 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
Depdc5P61460 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
Depdc5P61460 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
Depdc5P61460 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
Depdc5P61460 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
Depdc5P61460 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
Depdc5P61460 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC36.51■■■■□ 3.44
Depdc5P61460 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC36.51■■■■□ 3.44
Depdc5P61460 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC36.5■■■■□ 3.43
Depdc5P61460 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC36.49■■■■□ 3.43
Depdc5P61460 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.49■■■■□ 3.43
Depdc5P61460 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
Depdc5P61460 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
Depdc5P61460 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
Depdc5P61460 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC36.45■■■■□ 3.43
Depdc5P61460 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
Depdc5P61460 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
Depdc5P61460 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC36.44■■■■□ 3.42
Depdc5P61460 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
Depdc5P61460 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC36.43■■■■□ 3.42
Depdc5P61460 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.42■■■■□ 3.42
Depdc5P61460 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
Depdc5P61460 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC36.41■■■■□ 3.42
Depdc5P61460 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
Depdc5P61460 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
Depdc5P61460 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
Depdc5P61460 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
Depdc5P61460 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC36.38■■■■□ 3.41
Depdc5P61460 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
Depdc5P61460 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
Depdc5P61460 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
Depdc5P61460 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC36.36■■■■□ 3.41
Depdc5P61460 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
Depdc5P61460 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.36■■■■□ 3.41
Depdc5P61460 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC36.36■■■■□ 3.41
Depdc5P61460 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.35■■■■□ 3.41
Depdc5P61460 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC36.35■■■■□ 3.41
Depdc5P61460 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
Depdc5P61460 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
Depdc5P61460 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
Depdc5P61460 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
Depdc5P61460 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
Depdc5P61460 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC36.3■■■■□ 3.4
Depdc5P61460 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
Depdc5P61460 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
Depdc5P61460 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.28■■■■□ 3.4
Depdc5P61460 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC36.28■■■■□ 3.4
Depdc5P61460 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
Depdc5P61460 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.27■■■■□ 3.4
Depdc5P61460 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC36.25■■■■□ 3.39
Depdc5P61460 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
Depdc5P61460 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
Depdc5P61460 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
Depdc5P61460 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.24■■■■□ 3.39
Depdc5P61460 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
Depdc5P61460 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC36.23■■■■□ 3.39
Depdc5P61460 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC36.23■■■■□ 3.39
Depdc5P61460 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC36.23■■■■□ 3.39
Depdc5P61460 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC36.23■■■■□ 3.39
Depdc5P61460 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
Depdc5P61460 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
Depdc5P61460 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.22■■■■□ 3.39
Depdc5P61460 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC36.22■■■■□ 3.39
Depdc5P61460 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
Depdc5P61460 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
Depdc5P61460 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
Depdc5P61460 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
Depdc5P61460 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
Depdc5P61460 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC36.2■■■■□ 3.39
Depdc5P61460 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC36.19■■■■□ 3.38
Depdc5P61460 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC36.19■■■■□ 3.38
Depdc5P61460 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
Depdc5P61460 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.18■■■■□ 3.38
Depdc5P61460 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
Depdc5P61460 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
Depdc5P61460 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms