Protein–RNA interactions for Protein: P61406

Smg6, Telomerase-binding protein EST1A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg6P61406 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
Smg6P61406 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
Smg6P61406 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Smg6P61406 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Smg6P61406 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
Smg6P61406 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
Smg6P61406 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
Smg6P61406 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
Smg6P61406 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Smg6P61406 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Smg6P61406 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.74■■■□□ 2.83
Smg6P61406 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC32.74■■■□□ 2.83
Smg6P61406 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Smg6P61406 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC32.72■■■□□ 2.83
Smg6P61406 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC32.72■■■□□ 2.83
Smg6P61406 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
Smg6P61406 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
Smg6P61406 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
Smg6P61406 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
Smg6P61406 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC32.7■■■□□ 2.83
Smg6P61406 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
Smg6P61406 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Smg6P61406 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Smg6P61406 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC32.69■■■□□ 2.82
Smg6P61406 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC32.68■■■□□ 2.82
Smg6P61406 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Smg6P61406 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
Smg6P61406 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Smg6P61406 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
Smg6P61406 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC32.64■■■□□ 2.82
Smg6P61406 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
Smg6P61406 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC32.64■■■□□ 2.82
Smg6P61406 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
Smg6P61406 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Smg6P61406 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC32.61■■■□□ 2.81
Smg6P61406 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Smg6P61406 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.6■■■□□ 2.81
Smg6P61406 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.6■■■□□ 2.81
Smg6P61406 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Smg6P61406 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC32.6■■■□□ 2.81
Smg6P61406 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC32.59■■■□□ 2.81
Smg6P61406 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Smg6P61406 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Smg6P61406 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC32.58■■■□□ 2.81
Smg6P61406 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
Smg6P61406 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Smg6P61406 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Smg6P61406 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.55■■■□□ 2.8
Smg6P61406 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Smg6P61406 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Smg6P61406 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Smg6P61406 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Smg6P61406 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Smg6P61406 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Smg6P61406 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC32.54■■■□□ 2.8
Smg6P61406 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC32.53■■■□□ 2.8
Smg6P61406 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
Smg6P61406 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.8
Smg6P61406 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.79
Smg6P61406 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC32.51■■■□□ 2.79
Smg6P61406 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC32.51■■■□□ 2.79
Smg6P61406 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Smg6P61406 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Smg6P61406 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
Smg6P61406 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
Smg6P61406 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
Smg6P61406 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC32.48■■■□□ 2.79
Smg6P61406 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC32.48■■■□□ 2.79
Smg6P61406 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.48■■■□□ 2.79
Smg6P61406 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Smg6P61406 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Smg6P61406 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC32.46■■■□□ 2.79
Smg6P61406 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Smg6P61406 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Smg6P61406 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Smg6P61406 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC32.43■■■□□ 2.78
Smg6P61406 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Smg6P61406 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Smg6P61406 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Smg6P61406 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC32.42■■■□□ 2.78
Smg6P61406 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Smg6P61406 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Smg6P61406 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Smg6P61406 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
Smg6P61406 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.78
Smg6P61406 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Smg6P61406 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Smg6P61406 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Smg6P61406 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Smg6P61406 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Smg6P61406 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Smg6P61406 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC32.33■■■□□ 2.77
Smg6P61406 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.77
Smg6P61406 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
Smg6P61406 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Smg6P61406 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Smg6P61406 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
Smg6P61406 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.31■■■□□ 2.76
Smg6P61406 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Smg6P61406 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 6.9 ms