Protein–RNA interactions for Protein: P60335

Pcbp1, Poly(rC)-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcbp1P60335 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Pcbp1P60335 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Pcbp1P60335 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Pcbp1P60335 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Pcbp1P60335 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Pcbp1P60335 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Pcbp1P60335 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Pcbp1P60335 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Pcbp1P60335 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Pcbp1P60335 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Pcbp1P60335 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Pcbp1P60335 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Pcbp1P60335 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Pcbp1P60335 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Pcbp1P60335 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Pcbp1P60335 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Pcbp1P60335 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Pcbp1P60335 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Pcbp1P60335 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Pcbp1P60335 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Pcbp1P60335 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Pcbp1P60335 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Pcbp1P60335 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Pcbp1P60335 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Pcbp1P60335 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Pcbp1P60335 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Pcbp1P60335 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Pcbp1P60335 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Pcbp1P60335 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Pcbp1P60335 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Pcbp1P60335 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Pcbp1P60335 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Pcbp1P60335 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Pcbp1P60335 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Pcbp1P60335 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Pcbp1P60335 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Pcbp1P60335 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Pcbp1P60335 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Pcbp1P60335 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Pcbp1P60335 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Pcbp1P60335 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Pcbp1P60335 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Pcbp1P60335 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Pcbp1P60335 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Pcbp1P60335 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Pcbp1P60335 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Pcbp1P60335 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Pcbp1P60335 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Pcbp1P60335 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Pcbp1P60335 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Pcbp1P60335 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Pcbp1P60335 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Pcbp1P60335 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Pcbp1P60335 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Pcbp1P60335 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Pcbp1P60335 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Pcbp1P60335 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Pcbp1P60335 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Pcbp1P60335 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Pcbp1P60335 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Pcbp1P60335 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Pcbp1P60335 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Pcbp1P60335 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Pcbp1P60335 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Pcbp1P60335 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Pcbp1P60335 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Pcbp1P60335 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Pcbp1P60335 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Pcbp1P60335 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Pcbp1P60335 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Pcbp1P60335 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Pcbp1P60335 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Pcbp1P60335 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Pcbp1P60335 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Pcbp1P60335 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Pcbp1P60335 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Pcbp1P60335 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Pcbp1P60335 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Pcbp1P60335 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Pcbp1P60335 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Pcbp1P60335 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Pcbp1P60335 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Pcbp1P60335 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Pcbp1P60335 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Pcbp1P60335 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Pcbp1P60335 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Pcbp1P60335 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Pcbp1P60335 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Pcbp1P60335 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Pcbp1P60335 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Pcbp1P60335 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Pcbp1P60335 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Pcbp1P60335 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Pcbp1P60335 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Pcbp1P60335 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Pcbp1P60335 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Pcbp1P60335 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Pcbp1P60335 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Pcbp1P60335 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Pcbp1P60335 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms