Protein–RNA interactions for Protein: P59222

Scarf2, Scavenger receptor class F member 2, mousemouse

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scarf2P59222 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Scarf2P59222 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Scarf2P59222 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Scarf2P59222 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Scarf2P59222 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Scarf2P59222 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Scarf2P59222 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Scarf2P59222 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Scarf2P59222 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Scarf2P59222 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Scarf2P59222 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Scarf2P59222 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Scarf2P59222 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Scarf2P59222 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Scarf2P59222 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Scarf2P59222 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Scarf2P59222 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Scarf2P59222 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Scarf2P59222 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Scarf2P59222 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Scarf2P59222 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Scarf2P59222 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Scarf2P59222 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Scarf2P59222 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Scarf2P59222 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Scarf2P59222 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Scarf2P59222 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Scarf2P59222 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Scarf2P59222 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Scarf2P59222 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Scarf2P59222 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Scarf2P59222 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Scarf2P59222 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Scarf2P59222 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Scarf2P59222 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Scarf2P59222 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Scarf2P59222 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Scarf2P59222 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Scarf2P59222 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Scarf2P59222 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Scarf2P59222 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Scarf2P59222 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Scarf2P59222 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Scarf2P59222 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Scarf2P59222 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Scarf2P59222 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Scarf2P59222 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Scarf2P59222 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Scarf2P59222 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Scarf2P59222 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Scarf2P59222 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Scarf2P59222 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Scarf2P59222 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Scarf2P59222 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Scarf2P59222 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Scarf2P59222 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Scarf2P59222 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Scarf2P59222 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Scarf2P59222 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Scarf2P59222 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Scarf2P59222 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Scarf2P59222 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Scarf2P59222 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Scarf2P59222 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Scarf2P59222 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Scarf2P59222 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Scarf2P59222 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Scarf2P59222 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Scarf2P59222 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Scarf2P59222 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Scarf2P59222 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Scarf2P59222 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Scarf2P59222 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Scarf2P59222 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Scarf2P59222 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Scarf2P59222 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Scarf2P59222 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Scarf2P59222 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Scarf2P59222 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Scarf2P59222 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Scarf2P59222 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Scarf2P59222 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Scarf2P59222 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Scarf2P59222 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Scarf2P59222 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Scarf2P59222 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Scarf2P59222 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Scarf2P59222 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Scarf2P59222 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Scarf2P59222 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Scarf2P59222 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Scarf2P59222 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Scarf2P59222 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Scarf2P59222 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Scarf2P59222 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Scarf2P59222 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Scarf2P59222 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Scarf2P59222 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Scarf2P59222 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Scarf2P59222 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms