Protein–RNA interactions for Protein: P58466

Ctdsp1, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 1, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdsp1P58466 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ctdsp1P58466 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ctdsp1P58466 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ctdsp1P58466 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ctdsp1P58466 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ctdsp1P58466 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ctdsp1P58466 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ctdsp1P58466 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ctdsp1P58466 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ctdsp1P58466 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ctdsp1P58466 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ctdsp1P58466 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ctdsp1P58466 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ctdsp1P58466 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ctdsp1P58466 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ctdsp1P58466 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ctdsp1P58466 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ctdsp1P58466 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ctdsp1P58466 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ctdsp1P58466 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ctdsp1P58466 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ctdsp1P58466 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ctdsp1P58466 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ctdsp1P58466 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ctdsp1P58466 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ctdsp1P58466 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ctdsp1P58466 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ctdsp1P58466 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ctdsp1P58466 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ctdsp1P58466 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ctdsp1P58466 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ctdsp1P58466 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ctdsp1P58466 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ctdsp1P58466 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ctdsp1P58466 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ctdsp1P58466 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ctdsp1P58466 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ctdsp1P58466 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ctdsp1P58466 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ctdsp1P58466 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ctdsp1P58466 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ctdsp1P58466 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ctdsp1P58466 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ctdsp1P58466 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ctdsp1P58466 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ctdsp1P58466 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ctdsp1P58466 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ctdsp1P58466 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ctdsp1P58466 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ctdsp1P58466 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ctdsp1P58466 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ctdsp1P58466 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ctdsp1P58466 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ctdsp1P58466 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ctdsp1P58466 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ctdsp1P58466 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ctdsp1P58466 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ctdsp1P58466 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ctdsp1P58466 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ctdsp1P58466 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ctdsp1P58466 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ctdsp1P58466 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ctdsp1P58466 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ctdsp1P58466 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ctdsp1P58466 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Ctdsp1P58466 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ctdsp1P58466 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ctdsp1P58466 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ctdsp1P58466 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ctdsp1P58466 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ctdsp1P58466 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ctdsp1P58466 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ctdsp1P58466 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ctdsp1P58466 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ctdsp1P58466 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ctdsp1P58466 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ctdsp1P58466 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ctdsp1P58466 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ctdsp1P58466 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ctdsp1P58466 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ctdsp1P58466 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ctdsp1P58466 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ctdsp1P58466 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ctdsp1P58466 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ctdsp1P58466 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ctdsp1P58466 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ctdsp1P58466 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ctdsp1P58466 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ctdsp1P58466 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ctdsp1P58466 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ctdsp1P58466 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ctdsp1P58466 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ctdsp1P58466 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ctdsp1P58466 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ctdsp1P58466 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ctdsp1P58466 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ctdsp1P58466 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ctdsp1P58466 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ctdsp1P58466 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ctdsp1P58466 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 121 ms